Revista Ciencias Técnicas Agropecuarias Vol. 34, January-December 2025, ISSN: 2071-0054
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Original article

Differentiation of five commercial cultivars of Saccharum spp. using computational methods of VIS-NIR spectral analysis

 

iDKatia Ojito-Ramos1Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Facultad de Ciencias Agropecuarias, Departamento de Biología, Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: hbbrito@uclv.cu*✉:kojito@uclv.edu.cu

iDHilda Kirenia Barrientos-Brito1Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Facultad de Ciencias Agropecuarias, Departamento de Biología, Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: hbbrito@uclv.cu

iDOsmany de la C. Aday-Díaz2Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar Villa Clara (INICA Villa Clara), Cuba. E-mail: osmany.adad@inicavc.azcuba.cu

iDRubén Orozco-Morales3Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Centro de Investigaciones de Métodos Computacionales y Numéricos en la Ingeniería (CIMCNI), Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: rorozco@uclv.edu.cu

iDLuís Hernández-Santana4Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Grupo de Automatización, Robótica y Percepción (GARP), Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: luishs@uclv.edu.cu


1Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Facultad de Ciencias Agropecuarias, Departamento de Biología, Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: hbbrito@uclv.cu

2Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar Villa Clara (INICA Villa Clara), Cuba. E-mail: osmany.adad@inicavc.azcuba.cu

3Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Centro de Investigaciones de Métodos Computacionales y Numéricos en la Ingeniería (CIMCNI), Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: rorozco@uclv.edu.cu

4Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Grupo de Automatización, Robótica y Percepción (GARP), Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: luishs@uclv.edu.cu

 

*Autora para correspondencia: Katia Ojito-Ramos, e-mail: kojito@uclv.edu.cu

Abstract

Precision agriculture is applied to manage spatial variability in agricultural fields and optimize production. The objective of this study was to differentiate five commercial cultivars of Saccharum spp. (sugarcane) through computational spectral analysis methods. The vegetal material samples were collected in experimental areas of the Sugarcane Research Institute, located in the municipality of Ranchuelo, Villa Clara, Cuba. The commercial cultivars of Saccharum spp. were selected based on their characteristics and importance in Cuba; ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, ‘C1051-73’, and ‘C86-12’ were evaluated. The study focused on the spectral reflectance properties of the cultivars, using the first derivative method and ten spectral matching measures for analysis. It was identified that at 526.2 nm, 723.8 nm, and 1,399 nm, there are differences in the spectral characteristics gradients among the cultivars studied.

Keywords: 
Precision Agriculture, Sugarcane, Spectral Signature

Received: 28/6/2025; Accepted: 28/10/2025

The authors of this work declare no conflict of interest.

Authors' contributions: Conceptualization: Katia Ojito-Ramos, Osmany de la C., Aday Díaz, and Rubén Orozco Morales. Formal Analysis: Rubén Orozco Morales. Investigation: Katia Ojito-Ramos, Hilda Kirenia Barrientos Brito, Osmany de la C., Aday Díaz, and Rubén Orozco Morales. Methodology: Katia Ojito-Ramos, Osmany de la C., Aday Díaz, and Rubén Orozco Morales. Writing - original draft: Katia Ojito-Ramos and Hilda Kirenia Barrientos Brito. Writing - review & editing: Katia Ojito-Ramos, Hilda Kirenia Barrientos Brito, Osmany de la C., Aday Díaz, and Rubén Orozco Morales. Funding acquisition, Project Administration, and Supervision: Luís Hernández Santana.

The mention of trademarks of specific equipment, instruments, or materials is for identification purposes only, and there is no promotional commitment in relation to them, either by the author or the publisher.

CONTENT

Introduction

 

Sugarcane (Saccharum spp.) is one of the world's major crops (FAOSTAT, 2023FAOSTAT: Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y Agricultura, [en línea], Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y Agricultura, 2023, Disponible en: http://www.faostat.fao.org, [Consulta: 21 de abril de 2023].). In Cuba, the sugar sector is an important part of agro-industrial production and one of the main sources of income for the country’s economy (Reyes et al., 2021REYES, R.A.G.; GÓMEZ, J.A.V.; RUBIO, A.W.R.: “Sensoramiento remoto del rendimiento agrícola en caña de azúcar en Cacocum, Cuba”, Temas agrarios, 26(2): 152-159, 2021, ISSN: 0122-7610.). Several products are obtained from sugarcane, such as biofuels, ethanol, fibers, and sugar. Depending on these products, there are sugarcane cultivars with specific characteristics. For example, cultivars with high fiber content and cell walls that break easily, favoring the production of ethanol from bagasse; cultivars with a small stem diameter and high fiber content, which increase the strength of sugarcane for use in windy areas, among others (Phuphaphud et al., 2019PHUPHAPHUD, A.; SAENGPRACHATANARUG, K.; POSOM, J.; MARAPHUM, K.; TAIRA, E.: “Prediction of the fibre content of sugarcane stalk by direct scanning using visible-shortwave near infrared spectroscopy”, Vibrational spectroscopy, 101: 71-80, 2019, ISSN: 0924-2031.).

Knowing the real-time distribution of sugarcane cultivars is essential for improving crop productivity and quality (Ramírez-Gonzáles et al., 2019RAMÍREZ-GONZÁLES, M.; RODRÍGUEZ-MOREIRA, D.; RAMÍREZ-GONZÁLES, F.; BARCIA-SARDIÑAS, S.: “Variables meteorológicas y desarrollo fenológico de la caña de azúcar en Aguada de Pasajeros”, Revista Cubana de Meteorología, 25: 354-366, 2019, ISSN: 2664-0880.). The conventional method for studying the distribution of these cultivars is based on the use of traditional soil and topography maps, or on visual inspection of the field, which is laborious, requires the transfer of personnel, and, on occasion, the maps may be outdated, which limits accuracy (Espinoza and Luis, 2020ESPINOZA, F.; LUIS, F.: Caña de Azúcar-Manual Técnico, Ed. Instituto Paraguayo de Tecnología Agraria, Asunción, Paraguay, publisher: Caña de azúcar: Manual Técnico/Fernando Espinoza., 2020, ISBN: 99967-951-0-1.). Precision agriculture (PA) is a technology used to respond to and recognize spatial variation in a field, thereby improving the management of agricultural production processes (Udompetaikul et al., 2021UDOMPETAIKUL, V.; PHETPAN, K.; SIRISOMBOON, P.: “Development of the partial least-squares model to determine the soluble solids content of sugarcane billets on an elevator conveyor”, Measurement, 167: 107898, 2021, ISSN: 0263-2241.). Remote sensing techniques using satellite imagery have been widely applied in various fields of agricultural science. This is because they allow real-time information to be obtained from a given region without the need for travel, avoiding costs and also allowing the creation of more efficient methods for crop management and monitoring (Kai et al., 2020KAI, P.M.; DA COSTA, R.M.; DE OLIVEIRA, B.M.; FERNANDES, D.S.; FELIX, J.; SOARES, F.: “Discrimination of sugarcane varieties by remote sensing: A review of literature”, En: 2020 IEEE 44th Annual Computers, Software, and Applications Conference (COMPSAC), Ed. IEEE, pp. 1212-1217, 2020, ISBN: 1-7281-7303-5.).

Visible and near-infrared spectroscopy (VIS-NIR) appears to be a promising alternative due to its ability to detect signals from most of the main structures and functional groups of organic compounds (Camargo-Hernández et al., 2023CAMARGO-HERNÁNDEZ, D.B.; PARRA-FORERO, D.M.; VARON-RAMÍREZ, V.M.; LESMES-SUÁREZ, J.C.; BARONA-RODRÍGUEZ, A.F.; ARIZA-NIETO, C.: “Espectroscopía visible y del infrarrojo cercano para el análisis de nutrientes en tejido vegetal de caña de azúcar para producción de panela”, Revista UDCA Actualidad & Divulgación Científica, 26(1), 2023, ISSN: 0123-4226.). This technology allows for easy, fast, accurate, non-destructive, and economical analysis of the spatial variability of a crop without prior sample preparation. In addition, it has the potential for developing online measurement instruments (Udompetaikul et al., 2021UDOMPETAIKUL, V.; PHETPAN, K.; SIRISOMBOON, P.: “Development of the partial least-squares model to determine the soluble solids content of sugarcane billets on an elevator conveyor”, Measurement, 167: 107898, 2021, ISSN: 0263-2241.).

The objective of this work is to differentiate the commercial cultivars of Saccharum spp. ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, ‘C1051-73’, and ‘C86-12’ using computational methods of spectral analysis.

Materials and Methods

 

Determination of the spectral signatures of five commercial cultivars of Saccharum spp.

 

Leaf samples were collected in the morning between 8:00 and 10:00 a.m. in experimental areas of the Villa Clara Sugarcane Research Institute (INICA VC), located in the municipality of Ranchuelo, Villa Clara, Cuba. The prevailing environmental conditions at the time of collection were sunny, with no rain and some clouds. The soil type is classified as Salitic Brown, genetic type brown, subtype soft brown, and genus soft brown carbonate.

Four plots (replicas) planted with commercial sugarcane cultivars ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, ‘C1051-73’, and ‘C86-12’, six months old, were selected for collection. One plant per cultivar was randomly selected from each plot. Leaf blades +1 to +7 were collected from each plant according to the Kuijper system (1915)KUIJPER, J.: “DeGroei van Bladschijf, Bladscheede em Stengel van het suikerriet”, Arch Suikerind Ned Indië, 23(1): 528-556, 1915.. Commercial cultivars were selected based on their characteristics and importance in Cuba. After collection, the samples were stored at room temperature and hydrated. They were then transferred to the Spectroscopy Laboratory at Agricultural Research Center of the Faculty of Agricultural Sciences, located at Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas.

Determination of original spectral reflectance characteristics

 

To obtain the original spectral reflectance characteristics, a Corona Plus Remote spectrometer from the German company Carl Zeiss was used. This device uses an artificial light source produced by a halogen lamp and an optical system that illuminates the sample at 0° (normal to the sample) in an almost parallel beam. This equipment provides spectral reflectance measurements in 422 bands between 398 and 1,702 nm, with a spectral resolution of 10 nm, thus covering only the visible spectrum (VIS) and near-infrared (NIR) bands. The surveyed area was circular with a radius of 2.5 mm, equivalent to 20 mm². The leaf samples were placed in a linear arrangement in a Petri dish 10 mm deep and 35 mm in diameter, which was placed under the sensor at the center of the coordination point. The reflectance spectra were taken over the central area of the Petri dish, with the sample rotated approximately 30° between subsequent spectral acquisitions. Five reflectance spectra were taken from the base, five from the center, and five from the apex of each leaf collected, for a total of 15 spectra per leaf.

The data obtained with the spectrometer were first processed by Aspect Plus software, version 1.76 (C) on Windows, without smoothing. The reflectance characteristics were limited to the wavelength range between 432.384 and 1,673.385 nm. In addition, markedly atypical reflectance characteristics (outliers) were removed, and to attenuate disturbances in spectral reflectance characteristics that produced high-frequency reflectance noise, a finite impulse response (FIR) moving average (MA) smoothing was used, with a window of five samples (Sonobe and Hirono, 2022SONOBE, R.; HIRONO, Y.: “Applying variable selection methods and preprocessing techniques to hyperspectral reflectance data to estimate tea cultivar chlorophyll content”, Remote Sensing, 15(1): 19, 2022, ISSN: 2072-4292.).

Principal component extraction was performed using the principal component analysis (PCA) method. The normality of the data was tested using the JB-test, KS-test, L-test, and AD-test for each wavelength, the results of which were calculated from the data grouped and filtered by PCA, with a significance level of 1% (α = 1%), which is equivalent to a 99% confidence level. Under the assumption of normality in the data, the averages of the smoothed reflectance readings were determined for each of the samples of the different sugarcane cultivars, as well as their standard deviation. Subsequently, the First Derivative method was applied.

Comparison of five commercial cultivars of Saccharum spp. using ten Spectral Matching Measures

 

Ten Spectral Matching Measures (SMM) were used as methods of analysis between the cultivars of Saccharum spp. Classic SMM were used according to Hong et al. (2018)HONG, D.; YOKOYA, N.; CHANUSSOT, J.; ZHU, X.X.: “An augmented linear mixing model to address spectral variability for hyperspectral unmixing”, IEEE Transactions on Image Processing, 28(4): 1923-1938, 2018, ISSN: 1057-7149.; Drumetz et al. (2019)DRUMETZ, L.; MEYER, T.R.; CHANUSSOT, J.; BERTOZZI, A.L.; JUTTEN, C.: “Hyperspectral image unmixing with endmember bundles and group sparsity inducing mixed norms”, IEEE Transactions on Image Processing, 28(7): 3435-3450, 2019, ISSN: 1057-7149.; Borsoi et al. (2021)BORSOI, R.A.; IMBIRIBA, T.; BERMUDEZ, J.C.M.; RICHARD, C.; CHANUSSOT, J.; DRUMETZ, L.; TOURNERET, J.-Y.; ZARE, A.; JUTTEN, C.: “Spectral variability in hyperspectral data unmixing: A comprehensive review”, IEEE geoscience and remote sensing magazine, 9(4): 223-270, 2021, ISSN: 2168-6831.; Pathak et al. (2023)PATHAK, P.; CHALOPIN, C.; ZICK, L.; KÖHLER, H.; PFAHL, A.; RAYES, N.; GOCKEL, I.; NEUMUTH, T.; MELZER, A.; JANSEN-WINKELN, B.: “Spectral similarity measures for in vivo human tissue discrimination based on hyperspectral imaging”, Diagnostics, 13(2): 195, 2023, ISSN: 2075-4418., where ρ_(x) and ρ_y are the reflectances of the spectra of samples x and y, respectively, contained in M wavelengths, are defined as follows:

  • the spectral Euclidean distance (SED), given by:

SED x ,   y = x   ρ y 2 = i = 1 M ρ x i   ρ y i 2 1 / 2
 (1)
  • spectral angle measure (SAM) defined as:

SAM x ,   y = cos 1 ρ x · ρ y T ρ x 2 2 ρ y 2 2
 (2)

Where ρ x · ρ y T = i = 1 M ρ x i ρ y i represents the domestic product between ρ x y ρ y .

  • spectral correlation measure (SCM), defined as:

SCM x ,   y = i = 1 M ρ x i ρ ¯ x ρ y i ρ ¯ y i = 1 M ( ρ x i ρ ¯ x ) 2   i = 1 M ( ρ y i ρ ¯ y ) 2
 (3)

where ρ ¯ x is the average of the values of all elements of the reference spectrum vector, as is ρ ¯ y for the unknown spectrum.

  • spectral information divergence (SID), defined as:

SID x ,   y = D ( x   | |   y )   + D ( y   | |   x )
 (4)

where D ( x   | |   y ) the relative entropy or information distance of Kullback-Leibler de y with respect to x , a which is defined as:

D ( x   | |   y ) = i = 1 M p x i log p y i   log p x i
 (5)

Here, p x i   = x i / i = 1 M ρ x i corresponds to a normalized version of the spectrum x in the i-th spectral band.

  • the SID-SAM hybrid between the SID and SAM methods, called SIDSAM, which is reported to be a better discriminator than its separate components, obtained by:

SIDSAM x ,   y    = SID x ,   y tan [ SAM x ,   y
 (6)
  • the Bhattacharyya distance (BhattD), taking into account that they are p xi = ρ xi / i = 1 M ρ x i y p yi = ρ yi / i = 1 M ρ y i the normalized versions of the spectra ρ x y ρ y in the i-th spectral band, is given by:

BhattD x ,   y    = ln i = 1 M p x i p y i   
 (7)
  • the Jeffries-Matusita distance (JMD), where the separability criterion between two classes that are members of a set of classes C(x, y = 1, 2,..., C, xy), based on the JMD, has been defined as:

JMD x ,   y    =    2 1 e B h a t t D ρ x , ρ y
 (8)

being BhattD( x ,   y ) l the Bhattacharyya distance between classes ρ x y ρ y , given in (7) BhattD x ,   y    = ln i = 1 M p x i p y i    .

In addition, other SMMs were also used, such as the Dice spectral similarity coefficient (DSSC), the Kumar-Johnson spectral similarity coefficient (KJSSC), and the hybrid DSSC-KJSSC (KJDSSC) (Kumar et al., 2021KUMAR, C.; CHATTERJEE, S.; OOMMEN, T.; GUHA, A.: “New effective spectral matching measures for hyperspectral data analysis”, International Journal of Remote Sensing, 42(11): 4126-4156, 2021, ISSN: 0143-1161.).

  • the Dice spectral similarity coefficient (DSSC) is defined as:

DSSC x ,   y    =    2 i = 1 M ρ x i ρ y i i = 1 M ( ρ x i ) 2   +   i = 1 M ( ρ y i ) 2
 (9)
  • the Kumar-Johnson spectral similarity coefficient (KJSSC), given by:

KJSSC x ,   y    =    i = 1 M ρ x i 2 ρ y i 2 2 2 ρ x i ρ y i 3 / 2
 (10)
  • the KJDSSC hybrid, which is the hybrid option between KJSSC and DSSC given by:

KJDSSC x ,   y    = KJSSC x ,   y tan DSSC x ,   y  
  (11)

Finally, a metamerism analysis was performed on the SMMs.

Results and Discussion

 

In the original spectral reflectance characteristics, it was common for all cultivars to show a noisy band with greater amplitude fluctuations between 932 and 985 nm, with similar amplitude for all cultivars. Because the bandwidth of the spectral bands of the spectrometer used is 10 nm, much greater than that of other commercial spectrometers, which is only 1 nm, the degradation of the signal-to-noise ratio was low.

PCA was used to simplify the handling of the sampled data; this transformation was orthogonal, meaning that the principal components are independent of each other and are organized in such a way that the first captures the greatest variability present in the data, while each subsequent component represents progressively less variance. This allows the most significant characteristics to be identified by focusing on the highest eigenvalues (Che'Ya et al., 2022CHE’YA, N.N.; MOHIDEM, N.A.; ROSLIN, N.A.; SABERIOON, M.; TARMIDI, M.Z.; ARIF SHAH, J.; FAZLIL ILAHI, W.F.; MAN, N.: “Mobile computing for pest and disease management using spectral signature analysis: A review”, Agronomy, 12(4): 967, 2022, ISSN: 2073-4395.). After applying PCA to each of the cultivars, the normality of the data for each of the samples of each cultivar could be assumed. Subsequently, the averages of the smoothed reflectance readings were obtained. These mean values constitute the characteristic spectral signatures of each cultivar and differ mainly in the shape of the characteristic.

Figure 1 shows the average spectral signatures of each cultivar superimposed on a single image, allowing for a better appreciation of the differences between them. For the same cultivar, the set of characteristics varies from one reading to another mainly in amplitude, while from one cultivar to another, the differences are due to the shape of the characteristic. This involves the presence of different gradients between some spectral bands. The gradient (first derivative) does not depend on the amplitude of the reflectance characteristics, but rather on the abrupt changes in amplitude between adjacent wavelengths in these characteristics. These high-gradient changes are generally associated with reflectance peaks characteristic of the constituent elements of the analyzed cultivar (Che'Ya et al., 2022CHE’YA, N.N.; MOHIDEM, N.A.; ROSLIN, N.A.; SABERIOON, M.; TARMIDI, M.Z.; ARIF SHAH, J.; FAZLIL ILAHI, W.F.; MAN, N.: “Mobile computing for pest and disease management using spectral signature analysis: A review”, Agronomy, 12(4): 967, 2022, ISSN: 2073-4395.). Figure 2A shows the result of calculating the gradients of the characteristics of the samples of each cultivar, squaring them, averaging them, and smoothing them with a moving average filter with a window of five samples and zero-phase finite impulse response (FIR).

Figure 1.  Average reflectance characteristics of cultivars ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, ‘C1051-73’, ‘C86-12’, where ρ is the reflectance of the spectra.
Figure 2.  A Average reflectance gradient of the leaves of the cultivars under study, squared and smoothed. B Peaks of average reflectance gradient of the leaves of the cultivars under study at 526.2 nm. C Peaks of average reflectance gradient of the leaves of the cultivars under study at the red edge. D Peaks of average reflectance gradient of the leaves of the cultivars under study around 1,400 nm.

The characteristics shown in Figure 2 have a similar trend in terms of the high mean gradient peaks squared associated with the inflection points of the reflectance characteristics of each cultivar. However, these peaks are the key points that denote differences between the cultivars studied. It is important to note that these differences are not influenced by external factors, since all plants of the different cultivars were six months old (which corresponds to the rapid growth stage of the crop), were planted in adjacent areas with the same soil and climate conditions, and the samples were collected on the same day. Therefore, these high mean gradients squared peaks must be associated with the morphological and physiological differences of the cultivars under study. The reflectance characteristics of plants are due to the properties of the surface and internal structure of the leaf, as well as the distribution and concentration of its biochemical components (Peñuelas and Filella, 1998PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.).

As shown in Figure 2B, at 526.2 nm, all reflectance characteristics have a gradient peak, of which the highest gradient is produced by the cultivar ‘Ja60-5’, while the cultivar ‘C90-176’ produces the lowest gradient transition. These gradient peaks occur in the VIS region of the electromagnetic spectrum, which is in the range of 400-700 nm. The peaks in this region are related to the effect of chlorophylls and carotenoids (Peñuelas and Filella, 1998PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.). When sunlight strikes the leaves, part of it is absorbed in order to capture energy for photosynthesis. The energy that is not absorbed is reflected (Segarra et al., 2020SEGARRA, J.; BUCHAILLOT, M.L.; ARAUS, J.L.; KEFAUVER, S.C.: “Remote sensing for precision agriculture: Sentinel-2 improved features and applications”, Agronomy, 10(5): 641, 2020, ISSN: 2073-4395.; Singh et al., 2020SINGH, V.; SHARMA, N.; SINGH, S.: “A review of imaging techniques for plant disease detection”, Artificial Intelligence in Agriculture, 4: 229-242, 2020, ISSN: 2589-7217.; Sarić et al., 2022SARIĆ, R.; NGUYEN, V.D.; BURGE, T.; BERKOWITZ, O.; TRTÍLEK, M.; WHELAN, J.; LEWSEY, M.G.; ČUSTOVIĆ, E.: “Applications of hyperspectral imaging in plant phenotyping”, Trends in plant science, 27(3): 301-315, 2022, ISSN: 1360-1385.). This is defined as spectral reflection in the plant and can be described as the process whereby leaves absorb light in the visible blue and red range due to the presence of chlorophyll, leaving the dominant reflection in the green range of the electromagnetic spectrum (between 494-577 nm) (Aboelghar and Khdery, 2017ABOELGHAR, M.A.; KHDERY, G.A.: “Spectroscopic and morphological characteristics of genus Jatropha (Euphorbiaceae) and genus Jojoba (Simmondsiaceae)”, Asian Journal of Agriculture and Biology, 5(04), 2017, ISSN: 2307-8553.).

The average gradient peaks at 526.2 nm (green zone) differ between cultivars, which may be due to differences in the reflectance of the photosynthetic pigments of each cultivar. The minimum reflectance values correspond to the maximum absorption values (Peña et al., 2019PEÑA, L.; RENTERÍA, V.; VELÁSQUEZ, C.; OJEDA, M.L.; BARRERA, E.: “Absorbancia y reflectancia de hojas de Ficus contaminadas con nanopartículas de plata”, Revista mexicana de física, 65(1): 95-105, 2019, ISSN: 0035-001X.). Therefore, it can be deduced that the lower the reflectance value, the higher the absorbance value, which is directly proportional to the light energy used by the plant.

Certain studies have defined wavelengths that are used to calculate reflectance indices, which are used to determine the efficiency of the photosynthetic process (Peña et al., 2019PEÑA, L.; RENTERÍA, V.; VELÁSQUEZ, C.; OJEDA, M.L.; BARRERA, E.: “Absorbancia y reflectancia de hojas de Ficus contaminadas con nanopartículas de plata”, Revista mexicana de física, 65(1): 95-105, 2019, ISSN: 0035-001X.). It can be observed that lower reflectance values in the green zone of the VIS region correspond to better photosynthetic efficiency, so there is a negative correlation between them. The above allows us to infer that the cultivar ‘C90-176’, having the lowest peak at 526.2 nm, is the cultivar with the best photosynthetic efficiency. This corresponds to its characteristics, which, being an energy cane cultivar, requires more energy for biomass production (Abril-González et al., 2019ABRIL-GONZÁLEZ, A.; RAMIL-MESA, M.; MILÁN, D.A.; CAMPO-ZABALA, R.: “Caña energética como combustible de calderas de biomasa. Propuesta de precio como alternativa al petróleo y al carbón”, Icidca, 53: 9, 2019.).

Of the three areas of high average gradient peaks squared (526.2 nm, 723.8 nm, and 1,399 nm), the least representative in terms of the differentiation of the cultivars under study is the one occurring at 526.2 nm. This may be because the variability in reflectance between cultivars in the green region of the spectrum is limited because the optical properties of chlorophyll dominate the spectral response. This means that the peaks in this region do not provide relevant information for discriminating between cultivars, as they are less sensitive than the other two regions in the near-infrared region.

Figure 2C shows the average gradient peaks of the cultivars under study at the red edge (700-745 nm). The rate of change in this zone is greater for cultivar ‘C86-12’, while cultivar ‘C90-176’ has the lowest gradient in this band. High reflectance values at the red edge are associated with chlorophyll content in the leaf (Peñuelas and Filella, 1998PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.). The usefulness of derivative analysis of reflectance data in this region for vegetation identification has been highlighted (Thorp and Tian, 2004THORP, K.; TIAN, L.: “A review on remote sensing of weeds in agriculture”, Precision Agriculture, 5(5): 477-508, 2004, ISSN: 1385-2256.).

Of the three areas with high mean gradient peaks squared (526.2 nm, 723.8 nm, and 1,399 nm), the most important in terms of differentiating the cultivars under study is the one occurring at 723.8 nm. Although chlorophyll continues to influence this region (as it does in the 526.2 nm zone), reflectance around 700-745 nm is more sensitive to morphological and physiological differences between cultivars (Feng et al., 2013FENG, M.C.; WANG, J.J.; WANG, C.; YANG, W.D.; WANG, H.Q.; XIAO, L.J.; SONG, Y.H.; GAO, L.M.; ZHANG, M.J.; DING, G.W.: “Response of winter wheat (Triticum aestivum L.) spectral reflectance characteristics to chlorophyll content in planting densities application rate”, Bulgarian Journal of Agricultural Science, 19: 1190-1197, 2013.). This is because as wavelengths approach 700 nm, chlorophyll absorption decreases dramatically. After this point, the leaves begin to increase reflectance, marking the beginning of the red edge, a key feature in plant spectroscopy (Gausman, 1974GAUSMAN, H.W.: “Leaf reflectance of near-infrared”, Photogrammetric Engineering, 40(2): 183-191, 1974.). This abrupt change is sensitive to leaf conditions, such as chlorophyll content or cell structure (Peñuelas and Filella, 1998PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.), making it very useful for distinguishing between cultivars.

For this reason, although chlorophyll remains a determining factor in this region, differences in chlorophyll content between sugarcane cultivars can generate a more pronounced contrast around 723 nm. This allows the spectra to vary more noticeably between cultivars, which is not so much the case in the 526.2 nm range, where reflectance is more stabilized by the strong absorption of chlorophyll.

Finally, around 1,400 nm (NIR), all characteristics produce another zone with gradient peaks, with the highest gradient occurring in the ‘Ja60-5’ cultivar and the lowest gradient in the ‘C90-176’ cultivar (Figure 2D). These average gradient peaks at 1,400 nm are due to discontinuities between cell walls and intercellular air spaces in the internal structure of the leaf (Yuan et al., 2014YUAN, L.; HUANG, Y.; LORAAMM, R.W.; NIE, C.; WANG, J.; ZHANG, J.: “Spectral analysis of winter wheat leaves for detection and differentiation of diseases and insects”, Field Crops Research, 156: 199-207, 2014, ISSN: 0378-4290.; Katsoulas et al., 2016KATSOULAS, N.; ELVANIDI, A.; FERENTINOS, K.P.; KACIRA, M.; BARTZANAS, T.; KITTAS, C.: “Crop reflectance monitoring as a tool for water stress detection in greenhouses: A review”, Biosystems Engineering, 151: 374-398, 2016, ISSN: 1537-5110.). Although this wavelength is not directly linked to the biochemical processes of photosynthesis, it has an indirect relationship with them, especially in C4 plants such as sugarcane. These plants have developed a specialized mechanism to perform photosynthesis more efficiently under high light and temperature conditions. Part of this efficiency comes from their leaf structure, which optimizes CO2 capture and reduces photorespiration (Moore and Botha, 2014MOORE, P.H.; BOTHA, F.C.: Sugarcane: Physiology, Biochemistry, and Functional Biology, Inst. Wiley Blackwell Online Library, Nueva Delhi, India, publisher: Wiley Online Library, 2014.), which could be reflected in absorption or reflectance in this region of the spectrum.

The air spaces between cells allow for more efficient transport of CO2 to the cells specialized in photosynthesis in C4 plants. This characteristic is an advantage that is exploited in the photosynthetic process, as it is crucial in the carbohydrate synthesis phase. If reflectance at 1,400 nm is associated with the proportion of these intercellular spaces, it could be reflecting structural characteristics that favor efficient photosynthesis in C4 plants. Although the absorption of photons that enable chemical synthesis in photosynthesis itself occurs at visible wavelengths, the cellular architecture that facilitates this process manifests itself at NIR wavelengths.

Other authors have described that the NIR region comprising wavelengths of 1,300-1,400 nm is related to the interaction of incident energy with the mesophyll structure of the leaf (de Souza et al., 2020DE SOUZA, M.F.; DO AMARAL, L.R.; DE MEDEIROS OLIVEIRA, S.R.; COUTINHO, M.A.N.; NETTO, C.F.: “Spectral differentiation of sugarcane from weeds”, Biosystems Engineering, 190: 41-46, 2020, ISSN: 1537-5110.). Sugarcane is a monocotyledonous plant, and the leaves of this type of plant have more air spaces within the mesophyll than dicotyledonous species. Thus, this effect has a direct influence on the radiation scattering of Saccharum spp. cultivars. In addition, other mid-gradient peaks useful for the discrimination of cultivars and species have been described. For example, when differentiating between four Brazilian sugarcane cultivars using VIS-NIR spectroscopy, it was found that all wavelengths contributed to discriminating between sugarcane cultivars, but the 600-750 nm range was the most relevant (Neto et al., 2018NETO, A.S.; LOPES, D.; TOLEDO, J.; ZOLNIER, S.; SILVA, T. da: “Classification of sugarcane varieties using visible/near infrared spectral reflectance of stalks and multivariate methods”, The Journal of Agricultural Science, 156(4): 537-546, 2018, ISSN: 0021-8596.). Also, when differentiating sugarcane plants from weeds by the spectral behavior of the leaves, it was possible to simplify the spectrum into only four bands of interest (500-550 nm; 650-750 nm; 1,300-1,450 nm; and 1,800-1,900 nm) (de Souza et al., 2020DE SOUZA, M.F.; DO AMARAL, L.R.; DE MEDEIROS OLIVEIRA, S.R.; COUTINHO, M.A.N.; NETTO, C.F.: “Spectral differentiation of sugarcane from weeds”, Biosystems Engineering, 190: 41-46, 2020, ISSN: 1537-5110.). This indicates that the bands used in the differentiation may vary, as the spectral properties of plants depend on their physiological state, such as the concentration of chlorophyll and other photosynthetic pigments, the content and internal structure of the leaves, and the influence of biotic and abiotic stress.

The three high-gradient bands are clearly shown as peaks with maximum values that form different combinations for each cultivar, making it possible to create a feature space. This allows for the characterization of spectral variations, which makes it possible to identify the significant wavelengths from which discrimination and classification strategies can be implemented (Agarla et al., 2021AGARLA, M.; BIANCO, S.; CELONA, L.; SCHETTINI, R.; TCHOBANOU, M.: “An analysis of spectral similarity measures”, En: Color and Imaging Conference, Ed. Society for Imaging Science and Technology, vol. 29, pp. 300-305, 2021, ISBN: 2166-9635.).

The results confirm that, based on the VIS-NIR spectra, the cultivars show characteristic features that allow them to be differentiated from one another. In this way, it is possible to differentiate the presence of the five cultivars in the area based on the internal structure of the leaf, the variability in the constituent elements of each plant tissue, and their concentrations among the cultivars analyzed.

Comparison of five commercial cultivars of Saccharum spp. using ten spectral matching measures

 

Table 1 shows the results of the ten SMMs analyzed, representing the mean value and standard deviation among all samples of each cultivar, using reflectance characteristics with an amplitude between 0 and 1. In the measures that determine correlation (DSSC, SCM), the maximum values are represented in green, while the minimum values are represented in red. In the measures that determine distance (SED, BhattD, JMD), similarity (KJSSC, KJDSSC), measure (SAM), or divergence (SID, SIDSAM), the minimum values are represented in green, while the maximum values are represented in red.

The SED, given by (1) SED x ,   y = x   ρ y 2 = i = 1 M ρ x i   ρ y i 2 1 / 2 , was scaled by 0.5 as it depends on amplitudes. When it increases, it indicates a greater Euclidean distance between the spectra, which occurs between the cultivar ‘Ja60-5’ and the rest of the cultivars, with the highest value when compared to the cultivar ‘C90-176’. The lowest values for SED were obtained when comparing cultivars ‘C1051-73’ and ‘C10-171’. The SAM, given in (2) SAM x ,   y = cos 1 ρ x · ρ y T ρ x 2 2 ρ y 2 2 and converted to degrees (°), increases when there is greater angular separation between spectral characteristics, which is obtained between cultivars ‘C86-12’ and ‘C1051-73’, or ‘C90-176’, in that order. This is not the case for the SAM between cultivars ‘C1051-73’ and ‘C10-171’ or ‘Ja60-5’, in that order. The SCM, given in (3) SCM x ,   y = i = 1 M ρ x i ρ ¯ x ρ y i ρ ¯ y i = 1 M ( ρ x i ρ ¯ x ) 2   i = 1 M ( ρ y i ρ ¯ y ) 2 , when it decreases indicates lower spectral correlation, which is obtained between cultivars ‘C86-12’ and the rest of the cultivars; presenting the lowest value with cultivar ‘C1051-73’; This is not the case between cultivars ‘C1051-73’ and ‘C10-171’, ‘C1051-73’ and ‘Ja60-5’, and ‘C10-171’ and ‘Ja60-5’, where the first case has the highest spectral correlation. For SED, SAM, and SCM, the standard deviation values did not exceed the measured values.

On the other hand, the SID, given by (4) SID x ,   y = D ( x   | |   y )   + D ( y   | |   x ) and (5) D ( x   | |   y ) = i = 1 M p x i log p y i   log p x i scaled by 10, when it increases indicates greater divergence of information between the reflectance spectra, with the maximum divergences being obtained between cultivar ‘C86-12’ and the rest of the cultivars. The same does not occur between cultivars ‘C10-171’ and ‘C1051-73’, as the lowest divergence is obtained between them. The SIDSAM, given by (6) SIDSAM x ,   y    = SID x ,   y tan [ SAM x ,   y , also indicates greater spectral discrepancy when its value increases, which is obtained between cultivar ‘C86-12’ and the rest of the cultivars. As with SID, the smallest difference is obtained between cultivars ‘C10-171’ and ‘C1051-73’; however, the standard deviation in this case exceeds the mean value of the measurement for most values. The BhattD, given in (7) BhattD x ,   y    = ln i = 1 M p x i p y i    and scaled by 10, when its value increases denote more distance between the spectral characteristics, with the greatest distance being obtained between cultivars ‘C86-12’ and ‘C1051-73’. The smallest distance value was found between cultivars ‘C1051-73’ and ‘C10-171’.

Table 1.  Results of the ten SMMs analyzed, representing the mean value and standard deviation among all samples of each cultivar, using reluctance characteristics with an amplitude between 0 and 1.
‘Ja60-5’ ‘C10-171’ ‘C90-176’ ‘C1051-73’ ‘C86-12’
SED
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,8775±0,3750 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 1,1121±0,2320 0,5751±0,3462 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,8114±0,3700 0,4800±0,4132 0,6553±0,4357 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,9122±0,3076 0,6997±0,3372 0,6097±0,3444 0,5064±0,2046 0,0000±0,0000
SAM
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 3,7128±1,8715 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 5,1013±1,6607 4,8122±1,3868 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 3,4983±1,5855 3,3288±1,5049 5,1397±1,7213 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 5,5087±2,5736 4,7847±2,9583 6,0161±2,5451 6,0556±3,4557 0,0000±0,0000
SCM
‘Ja60-5’ 1,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,9909±0,0087 1,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,9873±0,0088 0,9876±0,0108 1,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,9909±0,0079 0,9911±0,0082 0,9844±0,0148 1,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,9781±0,0336 0,9801±0,0399 0,9769±0,0317 0,9691±0,0463 1,0000±0,0000
SID
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,1310±0,1169 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,2177±0,1730 0,1738±0,0881 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,1444±0,1184 0,1254±0,1082 0,2569±0,1395 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,3295±0,3064 0,2760±0,4364 0,3560±0,2952 0,4884±0,4919 0,0000±0,0000
SIDSAM
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,0119±0,0175 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,0240±0,0278 0,0160±0,0123 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,0115±0,0139 0,0099±0,0121 0,0265±0,0214 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,0451±0,0762 0,0454±0,1175 0,0499±0,0613 0,0810±0,1347 0,0000±0,0000
DSSC
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,7316±0,0133 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,7240±0,0107 0,7402±0,0103 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,7338±0,0116 0,7417±0,0114 0,7367±0,0139 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,7318±0,0121 0,7367±0,0104 0,7388±0,0109 0,7426±0,0064 0,0000±0,0000
KJSSC
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 3,6963±2,2523 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 5,4460±3,8620 2,0686±1,5693 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 3,1767±1,9155 1,7244±1,9981 2,8639±2,3213 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 4,8575±3,0803 3,0374±3,0098 2,7792±2,3586 3,2666±3,2931 0,0000±0,0000
KJDSSC
‘Ja60-5’ 1,0000±0,0000
‘C10-171’ 3,2709±1,9369 1,0000±0,0000
‘C90-176’ 4,7620±3,2647 1,8627±1,3667 1,0000±0,0000
‘C1051-73’ 2,8283±1,6631 1,5407±1,7439 2,5450±1,9921 1,0000±0,0000
‘C86-12’ 4,3072±2,5909 2,7148±2,6437 2,4937±2,0725 2,9617±2,9057 1,0000±0,0000
BhattD
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,0158±0,0143 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,0266±0,0209 0,0211±0,0106 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,0174±0,0142 0,0152±0,0131 0,0313±0,0168 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,0401±0,0374 0,0334±0,0520 0,0433±0,0358 0,0589±0,0591 0,0000±0,0000
JMD
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,0313±0,0279 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,0520±0,0401 0,0417±0,0207 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,0343±0,0277 0,0301±0,0257 0,0614±0,0324 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,0774±0,0690 0,0632±0,0933 0,0836±0,0673 0,1113±0,1061 0,0000±0,0000

Note: In measures that determine correlation (DSSC, SCM), maximum values are represented in green, while minimum values are represented in red. In measures that determine distance (SED, BhattD, JMD), similarity (KJSSC, KJDSSC), measure (SAM), or divergence (SID, SIDSAM), minimum values are represented in green, while maximum values are represented in red.

The JMD, given by (8) JMD x ,   y    =    2 1 e B h a t t D ρ x , ρ y , like the BhattD, when its value increases, denotes more distant spectra and has a nonlinear relationship with the BhattD, showing that the greatest distance values occur between cultivar ‘C86-12’ and the rest of the cultivars, with ‘C1051-73’ being the greatest of all. The smallest distance value occurs between cultivars ‘C10-171’ and ‘C1051-73’.

The DSSC, given by (9) DSSC x ,   y    =    2 i = 1 M ρ x i ρ y i i = 1 M ( ρ x i ) 2   +   i = 1 M ( ρ y i ) 2 and scaled by 0.75, decreases when the reflectance characteristics are less similar, which occurs between cultivar ‘Ja60-5’ and the rest of the cultivars, with the lowest value when compared to cultivar ‘C90-176’. The highest DSSC value is obtained between cultivars ‘C86-12’ and ‘C1051-73’. The KJSSC, given by (10) KJSSC x ,   y    =    i = 1 M ρ x i 2 ρ y i 2 2 2 ρ x i ρ y i 3 / 2 and scaled by 0.1, increases in value when the spectral characteristics are less similar, with the coefficients between cultivar ‘Ja60-5’ and the rest of the cultivars being the highest. In contrast, the cultivar ‘C10-171’ compared to ‘C1051-73’ obtains the lowest KJSSC value. Finally, the KJDSSC, given by (11) KJDSSC x ,   y    = KJSSC x ,   y tan DSSC x ,   y   , also increases in value when the spectral characteristics are less similar, with its results coinciding with those of the KJSSC.

The results of the ten SMMs show as a general pattern that cultivars ‘Ja60-5’ and ‘C86-12’ are the most different from the rest. In this sense, the cultivar ‘C86-12’ achieved the most significant values when compared to ‘C1051-73’; and the cultivar ‘Ja60-5’ obtained its most representative values when compared to ‘C90-176’. On the other hand, cultivars ‘C10-171’ and ‘C1051-73’ are the most similar to each other.

Only when a cultivar is compared with itself do the values of distance, similarity, measure, or divergence take on a value of zero, or the correlations take on a value of one; otherwise, metamerism would occur. Metamerism is the effect that occurs when two different spectra produce the same perception of the sources that reflect those spectra (Agarla et al., 2021AGARLA, M.; BIANCO, S.; CELONA, L.; SCHETTINI, R.; TCHOBANOU, M.: “An analysis of spectral similarity measures”, En: Color and Imaging Conference, Ed. Society for Imaging Science and Technology, vol. 29, pp. 300-305, 2021, ISBN: 2166-9635.). In this case, metamerism will occur between two spectral reflectance readings of different cultivars if the SMMs that determine distance (SED, BhattD, JMD), similarity (KJSSC, KJDSSC), measurement (SAM), or divergence (SID, SIDSAM) between them result in a value of zero, as well as when the SMMs that determine correlation (DSSC, SCM) result in a value of one.

In the analysis of the SMMs, none of the minimum values are zero, with SIDSAM producing the values closest to zero, mainly when comparing cultivar ‘C1051-73’ with ‘C10-171’ (0.0099); however, the SIDSAM values for these cultivar pairs are also low. On the other hand, the correlation measures (SCM and DSSC), which take a value of one when metamerism occurs, or when a species is compared with itself, obtain their highest value for the SCM when comparing cultivar ‘C1051-73’ with ‘C10-171’ (0.9911).

Finally, it can be noted that based on the results shown and after testing the normality of the reflectance values for the various readings of the same sample, the mean and standard deviation characteristics of each were determined. The bundle of these mean characteristics of the cultivars studied represented their variability. It was identified that, at 526.2 nm, 723.8 nm, and 1,399 nm, there are differences in the gradients of the spectral characteristics of the five cultivars studied. Various SMMs corroborated that it is possible to discriminate between cultivars without metamerism occurring. Of these, SED, SAM, and SCM provide the best results. In addition, these were the three spectral correspondence measures in which none of the standard deviation values exceeded the mean values.

Computational spectral analysis methods have been used to distinguish species and cultivars based on the assumption that each has certain characteristics that can be used to differentiate them from others, which are generally the shape, size, and reflectance of the leaves (Cisternas et al., 2020CISTERNAS, I.; VELÁSQUEZ, I.; CARO, A.; RODRÍGUEZ, A.: “Systematic literature review of implementations of precision agriculture”, Computers and Electronics in Agriculture, 176: 105626, 2020, ISSN: 0168-1699.). In a similar study, other wavelengths were identified for the discrimination of commercial cultivars of Saccharum spp. ranging from 560 to 720 nm (Johnson et al., 2008JOHNSON, R.M.; VIATOR, R.P.; VEREMIS, J.C.; RICHARD, E.P.; ZIMBA, P.V.: “Discriminación de variedades de caña de azúcar con perfiles de pigmentos y datos de reflectancia foliar hiperespectral de alta resolución”, Journal Association Sugar Cane Technologists, 28: 63-75, 2008.). The results indicate that the bands for discriminating cultivars may vary and should be investigated more closely to allow for adequate mapping of sugarcane cultivars, taking into account the area and characteristics of the cultivars under study.

The spectral signature of each cultivar has a different graphical curve depending on its specific characteristics. Therefore, a spectral library can be used to compare the reflectance of sugarcane cultivars in a field and estimate their frequency; in addition, this library can be used to discriminate and identify the location of the plant (Kai et al., 2020KAI, P.M.; DA COSTA, R.M.; DE OLIVEIRA, B.M.; FERNANDES, D.S.; FELIX, J.; SOARES, F.: “Discrimination of sugarcane varieties by remote sensing: A review of literature”, En: 2020 IEEE 44th Annual Computers, Software, and Applications Conference (COMPSAC), Ed. IEEE, pp. 1212-1217, 2020, ISBN: 1-7281-7303-5.).

Conclusions

 
  • It is possible to determine the spectral signatures of commercial cultivars of Saccharum spp., ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, 'C1051-73', ‘C86-12’, at 526.2 nm, 723.8 nm, and 1,399 nm, where at a reflectance wavelength of 526.2 nm, 723.8 nm, and 1,399 nm, there are differences in the gradients of their spectral characteristics.

  • The ten spectral correspondence measurements allow commercial cultivars of Saccharum spp. to be differentiated without metamerism occurring.

Acknowledgments

 

This article was made possible thanks to the research project “Solutions for agriculture and the environment based on unmanned vehicles, linked to a spatial data infrastructure,” from the National Program “Automation, Robotics, and Artificial Intelligence.” ARIA, PN223LH004

Bibliographical References

 

ABOELGHAR, M.A.; KHDERY, G.A.: “Spectroscopic and morphological characteristics of genus Jatropha (Euphorbiaceae) and genus Jojoba (Simmondsiaceae)”, Asian Journal of Agriculture and Biology, 5(04), 2017, ISSN: 2307-8553.

ABRIL-GONZÁLEZ, A.; RAMIL-MESA, M.; MILÁN, D.A.; CAMPO-ZABALA, R.: “Caña energética como combustible de calderas de biomasa. Propuesta de precio como alternativa al petróleo y al carbón”, Icidca, 53: 9, 2019.

AGARLA, M.; BIANCO, S.; CELONA, L.; SCHETTINI, R.; TCHOBANOU, M.: “An analysis of spectral similarity measures”, En: Color and Imaging Conference, Ed. Society for Imaging Science and Technology, vol. 29, pp. 300-305, 2021, ISBN: 2166-9635.

BORSOI, R.A.; IMBIRIBA, T.; BERMUDEZ, J.C.M.; RICHARD, C.; CHANUSSOT, J.; DRUMETZ, L.; TOURNERET, J.-Y.; ZARE, A.; JUTTEN, C.: “Spectral variability in hyperspectral data unmixing: A comprehensive review”, IEEE geoscience and remote sensing magazine, 9(4): 223-270, 2021, ISSN: 2168-6831.

CAMARGO-HERNÁNDEZ, D.B.; PARRA-FORERO, D.M.; VARON-RAMÍREZ, V.M.; LESMES-SUÁREZ, J.C.; BARONA-RODRÍGUEZ, A.F.; ARIZA-NIETO, C.: “Espectroscopía visible y del infrarrojo cercano para el análisis de nutrientes en tejido vegetal de caña de azúcar para producción de panela”, Revista UDCA Actualidad & Divulgación Científica, 26(1), 2023, ISSN: 0123-4226.

CHE’YA, N.N.; MOHIDEM, N.A.; ROSLIN, N.A.; SABERIOON, M.; TARMIDI, M.Z.; ARIF SHAH, J.; FAZLIL ILAHI, W.F.; MAN, N.: “Mobile computing for pest and disease management using spectral signature analysis: A review”, Agronomy, 12(4): 967, 2022, ISSN: 2073-4395.

CISTERNAS, I.; VELÁSQUEZ, I.; CARO, A.; RODRÍGUEZ, A.: “Systematic literature review of implementations of precision agriculture”, Computers and Electronics in Agriculture, 176: 105626, 2020, ISSN: 0168-1699.

DE SOUZA, M.F.; DO AMARAL, L.R.; DE MEDEIROS OLIVEIRA, S.R.; COUTINHO, M.A.N.; NETTO, C.F.: “Spectral differentiation of sugarcane from weeds”, Biosystems Engineering, 190: 41-46, 2020, ISSN: 1537-5110.

DRUMETZ, L.; MEYER, T.R.; CHANUSSOT, J.; BERTOZZI, A.L.; JUTTEN, C.: “Hyperspectral image unmixing with endmember bundles and group sparsity inducing mixed norms”, IEEE Transactions on Image Processing, 28(7): 3435-3450, 2019, ISSN: 1057-7149.

ESPINOZA, F.; LUIS, F.: Caña de Azúcar-Manual Técnico, Ed. Instituto Paraguayo de Tecnología Agraria, Asunción, Paraguay, publisher: Caña de azúcar: Manual Técnico/Fernando Espinoza., 2020, ISBN: 99967-951-0-1.

FAOSTAT: Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y Agricultura, [en línea], Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y Agricultura, 2023, Disponible en: http://www.faostat.fao.org, [Consulta: 21 de abril de 2023].

FENG, M.C.; WANG, J.J.; WANG, C.; YANG, W.D.; WANG, H.Q.; XIAO, L.J.; SONG, Y.H.; GAO, L.M.; ZHANG, M.J.; DING, G.W.: “Response of winter wheat (Triticum aestivum L.) spectral reflectance characteristics to chlorophyll content in planting densities application rate”, Bulgarian Journal of Agricultural Science, 19: 1190-1197, 2013.

GAUSMAN, H.W.: “Leaf reflectance of near-infrared”, Photogrammetric Engineering, 40(2): 183-191, 1974.

HONG, D.; YOKOYA, N.; CHANUSSOT, J.; ZHU, X.X.: “An augmented linear mixing model to address spectral variability for hyperspectral unmixing”, IEEE Transactions on Image Processing, 28(4): 1923-1938, 2018, ISSN: 1057-7149.

JOHNSON, R.M.; VIATOR, R.P.; VEREMIS, J.C.; RICHARD, E.P.; ZIMBA, P.V.: “Discriminación de variedades de caña de azúcar con perfiles de pigmentos y datos de reflectancia foliar hiperespectral de alta resolución”, Journal Association Sugar Cane Technologists, 28: 63-75, 2008.

KAI, P.M.; DA COSTA, R.M.; DE OLIVEIRA, B.M.; FERNANDES, D.S.; FELIX, J.; SOARES, F.: “Discrimination of sugarcane varieties by remote sensing: A review of literature”, En: 2020 IEEE 44th Annual Computers, Software, and Applications Conference (COMPSAC), Ed. IEEE, pp. 1212-1217, 2020, ISBN: 1-7281-7303-5.

KATSOULAS, N.; ELVANIDI, A.; FERENTINOS, K.P.; KACIRA, M.; BARTZANAS, T.; KITTAS, C.: “Crop reflectance monitoring as a tool for water stress detection in greenhouses: A review”, Biosystems Engineering, 151: 374-398, 2016, ISSN: 1537-5110.

KUIJPER, J.: “DeGroei van Bladschijf, Bladscheede em Stengel van het suikerriet”, Arch Suikerind Ned Indië, 23(1): 528-556, 1915.

KUMAR, C.; CHATTERJEE, S.; OOMMEN, T.; GUHA, A.: “New effective spectral matching measures for hyperspectral data analysis”, International Journal of Remote Sensing, 42(11): 4126-4156, 2021, ISSN: 0143-1161.

MOORE, P.H.; BOTHA, F.C.: Sugarcane: Physiology, Biochemistry, and Functional Biology, Inst. Wiley Blackwell Online Library, Nueva Delhi, India, publisher: Wiley Online Library, 2014.

NETO, A.S.; LOPES, D.; TOLEDO, J.; ZOLNIER, S.; SILVA, T. da: “Classification of sugarcane varieties using visible/near infrared spectral reflectance of stalks and multivariate methods”, The Journal of Agricultural Science, 156(4): 537-546, 2018, ISSN: 0021-8596.

PATHAK, P.; CHALOPIN, C.; ZICK, L.; KÖHLER, H.; PFAHL, A.; RAYES, N.; GOCKEL, I.; NEUMUTH, T.; MELZER, A.; JANSEN-WINKELN, B.: “Spectral similarity measures for in vivo human tissue discrimination based on hyperspectral imaging”, Diagnostics, 13(2): 195, 2023, ISSN: 2075-4418.

PEÑA, L.; RENTERÍA, V.; VELÁSQUEZ, C.; OJEDA, M.L.; BARRERA, E.: “Absorbancia y reflectancia de hojas de Ficus contaminadas con nanopartículas de plata”, Revista mexicana de física, 65(1): 95-105, 2019, ISSN: 0035-001X.

PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.

PHUPHAPHUD, A.; SAENGPRACHATANARUG, K.; POSOM, J.; MARAPHUM, K.; TAIRA, E.: “Prediction of the fibre content of sugarcane stalk by direct scanning using visible-shortwave near infrared spectroscopy”, Vibrational spectroscopy, 101: 71-80, 2019, ISSN: 0924-2031.

RAMÍREZ-GONZÁLES, M.; RODRÍGUEZ-MOREIRA, D.; RAMÍREZ-GONZÁLES, F.; BARCIA-SARDIÑAS, S.: “Variables meteorológicas y desarrollo fenológico de la caña de azúcar en Aguada de Pasajeros”, Revista Cubana de Meteorología, 25: 354-366, 2019, ISSN: 2664-0880.

REYES, R.A.G.; GÓMEZ, J.A.V.; RUBIO, A.W.R.: “Sensoramiento remoto del rendimiento agrícola en caña de azúcar en Cacocum, Cuba”, Temas agrarios, 26(2): 152-159, 2021, ISSN: 0122-7610.

SARIĆ, R.; NGUYEN, V.D.; BURGE, T.; BERKOWITZ, O.; TRTÍLEK, M.; WHELAN, J.; LEWSEY, M.G.; ČUSTOVIĆ, E.: “Applications of hyperspectral imaging in plant phenotyping”, Trends in plant science, 27(3): 301-315, 2022, ISSN: 1360-1385.

SEGARRA, J.; BUCHAILLOT, M.L.; ARAUS, J.L.; KEFAUVER, S.C.: “Remote sensing for precision agriculture: Sentinel-2 improved features and applications”, Agronomy, 10(5): 641, 2020, ISSN: 2073-4395.

SINGH, V.; SHARMA, N.; SINGH, S.: “A review of imaging techniques for plant disease detection”, Artificial Intelligence in Agriculture, 4: 229-242, 2020, ISSN: 2589-7217.

SONOBE, R.; HIRONO, Y.: “Applying variable selection methods and preprocessing techniques to hyperspectral reflectance data to estimate tea cultivar chlorophyll content”, Remote Sensing, 15(1): 19, 2022, ISSN: 2072-4292.

THORP, K.; TIAN, L.: “A review on remote sensing of weeds in agriculture”, Precision Agriculture, 5(5): 477-508, 2004, ISSN: 1385-2256.

UDOMPETAIKUL, V.; PHETPAN, K.; SIRISOMBOON, P.: “Development of the partial least-squares model to determine the soluble solids content of sugarcane billets on an elevator conveyor”, Measurement, 167: 107898, 2021, ISSN: 0263-2241.

YUAN, L.; HUANG, Y.; LORAAMM, R.W.; NIE, C.; WANG, J.; ZHANG, J.: “Spectral analysis of winter wheat leaves for detection and differentiation of diseases and insects”, Field Crops Research, 156: 199-207, 2014, ISSN: 0378-4290.


Revista Ciencias Técnicas Agropecuarias Vol. 34, January-December 2025, ISSN: 2071-0054
 
Artículo original

Diferenciación de cinco cultivares comerciales de Saccharum spp. mediante métodos computacionales de análisis espectral VIS-NIR

 

iDKatia Ojito-Ramos1Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Facultad de Ciencias Agropecuarias, Departamento de Biología, Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: hbbrito@uclv.cu*✉:kojito@uclv.edu.cu

iDHilda Kirenia Barrientos-Brito1Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Facultad de Ciencias Agropecuarias, Departamento de Biología, Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: hbbrito@uclv.cu

iDOsmany de la C. Aday-Díaz2Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar Villa Clara (INICA Villa Clara), Cuba. E-mail: osmany.adad@inicavc.azcuba.cu

iDRubén Orozco-Morales3Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Centro de Investigaciones de Métodos Computacionales y Numéricos en la Ingeniería (CIMCNI), Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: rorozco@uclv.edu.cu

iDLuís Hernández-Santana4Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Grupo de Automatización, Robótica y Percepción (GARP), Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: luishs@uclv.edu.cu


1Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Facultad de Ciencias Agropecuarias, Departamento de Biología, Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: hbbrito@uclv.cu

2Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar Villa Clara (INICA Villa Clara), Cuba. E-mail: osmany.adad@inicavc.azcuba.cu

3Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Centro de Investigaciones de Métodos Computacionales y Numéricos en la Ingeniería (CIMCNI), Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: rorozco@uclv.edu.cu

4Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas (UCLV), Grupo de Automatización, Robótica y Percepción (GARP), Santa Clara, Villa Clara, Cuba. E-mail: luishs@uclv.edu.cu

 

*Autora para correspondencia: Katia Ojito-Ramos, e-mail: kojito@uclv.edu.cu

Resumen

La agricultura de precisión se aplica para gestionar la variabilidad espacial en campos agrícolas y optimizar la producción. El objetivo del trabajo fue diferenciar cinco cultivares comerciales de caña de azúcar (Saccharum spp.) mediante métodos computacionales de análisis espectral. Las colectas del material vegetal se realizaron en áreas experimentales del Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar, ubicado en el municipio de Ranchuelo, Villa Clara, Cuba. Los cultivares comerciales se seleccionaron de acuerdo a sus características e importancia en Cuba; se evaluaron ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, ‘C1051-73’, ‘C86-12’. El trabajo se centró en el estudio de las propiedades de reflectancia espectral de los cultivares y como métodos de análisis se utilizó el método de la primera derivada y diez medidas de correspondencia espectral. Se identificó que, a 526,2 nm, 723,8 nm y a 1 399 nm existen diferencias en los gradientes de las características espectrales entre los cultivares en estudio.

Palabras clave: 
agricultura de precisión, caña de azúcar, firma espectral

Introducción

 

La caña de azúcar (Saccharum spp.) constituye uno de los principales cultivos a nivel mundial (FAOSTAT, 2023FAOSTAT: Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y Agricultura, [en línea], Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y Agricultura, 2023, Disponible en: http://www.faostat.fao.org, [Consulta: 21 de abril de 2023].). En Cuba, el sector azucarero es un renglón importante en la producción agroindustrial; y una de las principales fuentes de ingreso a la economía del país (Reyes et al., 2021REYES, R.A.G.; GÓMEZ, J.A.V.; RUBIO, A.W.R.: “Sensoramiento remoto del rendimiento agrícola en caña de azúcar en Cacocum, Cuba”, Temas agrarios, 26(2): 152-159, 2021, ISSN: 0122-7610.). De la caña de azúcar se obtienen varios productos como biocombustibles, etanol, fibras y azúcar, en función de estos, existen cultivares de caña de azúcar con características específicas. Por ejemplo, cultivares con alto contenido de fibra y paredes celulares que se rompen fácilmente, favoreciendo la producción de etanol a partir de bagazo; cultivares con un diámetro de tallo pequeño y alto contenido de fibra, que aumentan la fuerza de la caña de azúcar para su uso en áreas ventosas, entre otros (Phuphaphud et al., 2019PHUPHAPHUD, A.; SAENGPRACHATANARUG, K.; POSOM, J.; MARAPHUM, K.; TAIRA, E.: “Prediction of the fibre content of sugarcane stalk by direct scanning using visible-shortwave near infrared spectroscopy”, Vibrational spectroscopy, 101: 71-80, 2019, ISSN: 0924-2031.).

Conocer la distribución en tiempo real de los cultivares de caña de azúcar es fundamental para mejorar la productividad y la calidad del cultivo (Ramírez-Gonzáles et al., 2019RAMÍREZ-GONZÁLES, M.; RODRÍGUEZ-MOREIRA, D.; RAMÍREZ-GONZÁLES, F.; BARCIA-SARDIÑAS, S.: “Variables meteorológicas y desarrollo fenológico de la caña de azúcar en Aguada de Pasajeros”, Revista Cubana de Meteorología, 25: 354-366, 2019, ISSN: 2664-0880.). El método convencional para el estudio de la distribución de dichos cultivares está basado en el uso de mapas tradicionales de suelo y topografía, o en la inspección visual del campo, lo cual resulta laborioso, requiere el traslado del personal y, en ocasiones, los mapas pueden estar desactualizados, lo cual limita la precisión (Espinoza y Luis, 2020ESPINOZA, F.; LUIS, F.: Caña de Azúcar-Manual Técnico, Ed. Instituto Paraguayo de Tecnología Agraria, Asunción, Paraguay, publisher: Caña de azúcar: Manual Técnico/Fernando Espinoza., 2020, ISBN: 99967-951-0-1.). La agricultura de precisión (AP) es una tecnología utilizada para responder y reconocer la variación espacial sobre un campo; y así mejorar la gestión de los procesos de producción agrícola (Udompetaikul et al., 2021UDOMPETAIKUL, V.; PHETPAN, K.; SIRISOMBOON, P.: “Development of the partial least-squares model to determine the soluble solids content of sugarcane billets on an elevator conveyor”, Measurement, 167: 107898, 2021, ISSN: 0263-2241.). Las técnicas de teledetección mediante imágenes satelitales se han aplicado ampliamente en diversos campos de las ciencias agrarias. Esto se debe a que permiten obtener información en tiempo real de una región determinada sin necesidad de desplazamiento, evitan costos y también permiten la creación de métodos más eficientes para el manejo y monitoreo de los cultivos (Kai et al., 2020KAI, P.M.; DA COSTA, R.M.; DE OLIVEIRA, B.M.; FERNANDES, D.S.; FELIX, J.; SOARES, F.: “Discrimination of sugarcane varieties by remote sensing: A review of literature”, En: 2020 IEEE 44th Annual Computers, Software, and Applications Conference (COMPSAC), Ed. IEEE, pp. 1212-1217, 2020, ISBN: 1-7281-7303-5.).

La espectroscopía visible y del infrarrojo cercano (VIS-NIR) aparece como una alternativa prometedora, debido a su capacidad de detectar señales de la mayoría de las principales estructuras y grupos funcionales de compuestos orgánicos (Camargo-Hernández et al., 2023CAMARGO-HERNÁNDEZ, D.B.; PARRA-FORERO, D.M.; VARON-RAMÍREZ, V.M.; LESMES-SUÁREZ, J.C.; BARONA-RODRÍGUEZ, A.F.; ARIZA-NIETO, C.: “Espectroscopía visible y del infrarrojo cercano para el análisis de nutrientes en tejido vegetal de caña de azúcar para producción de panela”, Revista UDCA Actualidad & Divulgación Científica, 26(1), 2023, ISSN: 0123-4226.). Esta tecnología permite analizar la variabilidad espacial de un cultivo de manera fácil, rápida, precisa, no destructiva y económica; sin la preparación previa de la muestra. Además, tiene potencial para desarrollar instrumentos de mediciones en línea (Udompetaikul et al., 2021UDOMPETAIKUL, V.; PHETPAN, K.; SIRISOMBOON, P.: “Development of the partial least-squares model to determine the soluble solids content of sugarcane billets on an elevator conveyor”, Measurement, 167: 107898, 2021, ISSN: 0263-2241.).

Este trabajo tiene como objetivo diferenciar los cultivares comerciales de Saccharum spp. ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, ‘C1051-73’, ‘C86-12’ mediante métodos computacionales de análisis espectral.

Materiales y Métodos

 

Determinación de las firmas espectrales de cinco cultivares comerciales de Saccharum spp.

 

La colecta de las muestras foliares se realizó en horario de la mañana de 8:00 a 10:00; en áreas experimentales del Instituto de Investigaciones de la Caña de Azúcar de Villa Clara (INICA VC), ubicado en el municipio de Ranchuelo, Villa Clara, Cuba. Las condiciones ambientales predominantes en el momento de la colecta fueron de día soleado, sin lluvia y con algunas nubes. La clasificación del tipo de suelo es Pardo Salítico, de tipo genético pardo, subtipo pardo mullido y de género pardo mullido carbonatado.

Para la colecta se seleccionaron cuatro parcelas (réplicas) plantadas con los cultivares comerciales de caña de azúcar, ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, ‘C1051-73’, ‘C86-12’; con seis meses de edad. En cada parcela se eligió una planta al azar por cultivar. De cada planta se colectaron las láminas foliares de la +1 a la +7 según la enumeración del sistema de Kuijper (1915)KUIJPER, J.: “DeGroei van Bladschijf, Bladscheede em Stengel van het suikerriet”, Arch Suikerind Ned Indië, 23(1): 528-556, 1915.. Los cultivares comerciales fueron seleccionados según sus características y su importancia en Cuba. Luego de colectadas las muestras, fueron conservadas a temperatura ambiente e hidratadas. Posteriormente, fueron trasladadas hasta el Laboratorio de Espectroscopía del Centro de Investigaciones Agropecuarias de la Facultad de Ciencias Agropecuarias, ubicado en la Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas.

Determinación de las características de reflectancia espectral originales

 

Para la obtención de las características de reflectancia espectral originales se utilizó un espectrómetro Corona Plus Remote, de la firma alemana Carl Zeiss; que utiliza fuente de iluminación artificial producida por una lámpara de alógeno y un sistema óptico que proporciona una iluminación de la muestra a 0° (normal a la muestra), en un haz casi paralelo. Este equipo proporciona medidas de reflectancia espectral en 422 bandas entre 398 y 1 702 nm, con una resolución espectral de 10 nm, por lo que solo cubre las bandas del espectro visible (VIS) y del infrarrojo cercano (NIR). El área de censado fue circular con un radio de 2,5 mm, equivalente a 20 mm2. Las muestras de hojas se colocaron de manera organizada linealmente en una placa de Petri de 10 mm de profundidad y 35 mm de diámetro, la cual se dispuso debajo del sensor en el centro del punto de coordinación. Los espectros de reflectancia se tomaron sobre la zona central de la placa de Petri, con una rotación de la muestra aproximadamente de 30° entre las adquisiciones espectrales posteriores. Se tomaron 5 espectros de reflectancia de la base, 5 del centro y 5 del ápice de cada hoja colectada, para un total de 15 espectros por hoja.

Los datos que se obtuvieron con el espectrómetro fueron procesados primeramente por el software Aspect Plus, versión 1,76 (C) sobre Windows sin realizar suavizado. Las características de reflectancia se delimitaron al intervalo de longitudes de onda entre 432,384 y 1 673,385 nm. Además, se eliminaron las características de reflectancia marcadamente atípicas (outliers), y para atenuar las perturbaciones de las características de reflectancia espectral que produjeron ruido de reflectancia de alta frecuencia, se utilizó un suavizado de promedio móvil (MA) de respuesta finita al impulso (FIR), con ventana de cinco muestras (Sonobe y Hirono, 2022SONOBE, R.; HIRONO, Y.: “Applying variable selection methods and preprocessing techniques to hyperspectral reflectance data to estimate tea cultivar chlorophyll content”, Remote Sensing, 15(1): 19, 2022, ISSN: 2072-4292.).

Se realizó la extracción de componentes principales mediante el método de Análisis de Componentes Principales (PCA; del inglés, principal component analysis). Se probó la normalidad de los datos usando las pruebas JB-test, KS-test, L-test y AD-test para cada longitud de onda, cuyos resultados fueron calculados a partir de los datos agrupados y filtrados por PCA; con un nivel de significancia del 1% (α = 1%), lo que equivale a un 99% de confianza. Bajo el supuesto de normalidad en los datos se determinaron los promedios de las lecturas de reflectancia suavizadas para cada una de las muestras de los distintos cultivares de caña de azúcar, así como su desviación estándar. Posteriormente, se aplicó el método de la Primera Derivada.

Comparación de cinco cultivares comerciales de Saccharum spp. mediante diez Medidas de Correspondencia Espectral

 

Como métodos de análisis se utilizaron diez Medidas de correspondencia espectral (SMM; del inglés, Spectral Matching Measures), entre los cultivares de Saccharum spp. Se utilizaron SMM clásicas según Hong et al. (2018)HONG, D.; YOKOYA, N.; CHANUSSOT, J.; ZHU, X.X.: “An augmented linear mixing model to address spectral variability for hyperspectral unmixing”, IEEE Transactions on Image Processing, 28(4): 1923-1938, 2018, ISSN: 1057-7149.; Drumetz et al. (2019)DRUMETZ, L.; MEYER, T.R.; CHANUSSOT, J.; BERTOZZI, A.L.; JUTTEN, C.: “Hyperspectral image unmixing with endmember bundles and group sparsity inducing mixed norms”, IEEE Transactions on Image Processing, 28(7): 3435-3450, 2019, ISSN: 1057-7149.; Borsoi et al. (2021)BORSOI, R.A.; IMBIRIBA, T.; BERMUDEZ, J.C.M.; RICHARD, C.; CHANUSSOT, J.; DRUMETZ, L.; TOURNERET, J.-Y.; ZARE, A.; JUTTEN, C.: “Spectral variability in hyperspectral data unmixing: A comprehensive review”, IEEE geoscience and remote sensing magazine, 9(4): 223-270, 2021, ISSN: 2168-6831.; Pathak et al. (2023)PATHAK, P.; CHALOPIN, C.; ZICK, L.; KÖHLER, H.; PFAHL, A.; RAYES, N.; GOCKEL, I.; NEUMUTH, T.; MELZER, A.; JANSEN-WINKELN, B.: “Spectral similarity measures for in vivo human tissue discrimination based on hyperspectral imaging”, Diagnostics, 13(2): 195, 2023, ISSN: 2075-4418., siendo ρ x   y ρ y las reflectancias de los espectros de las muestras x y y respectivamente, obtenidas en M longitudes de onda, se definen:

  • la distancia Euclidiana espectral (SED), dada por:

SED x ,   y = x   ρ y 2 = i = 1 M ρ x i   ρ y i 2 1 / 2
 (1)
  • la medida del ángulo espectral (SAM) definida como:

SAM x ,   y = cos 1 ρ x · ρ y T ρ x 2 2 ρ y 2 2
 (2)

Donde ρ x · ρ y T = i = 1 M ρ x i ρ y i representa el producto interno entre ρ x y ρ y .

  • la medida de la correlación espectral (SCM), definida como:

SCM x ,   y = i = 1 M ρ x i ρ ¯ x ρ y i ρ ¯ y i = 1 M ( ρ x i ρ ¯ x ) 2   i = 1 M ( ρ y i ρ ¯ y ) 2
 (3)

donde ρ ¯ x es la media de los valores de todos los elementos del vector del espectro de referencia, al igual que lo es ρ ¯ y para el espectro incógnito.

  • la divergencia de la información espectral (SID), definida como:

SID x ,   y = D ( x   | |   y )   + D ( y   | |   x )
 (4)

donde D ( x   | |   y ) se considera la entropía relativa o distancia de información de Kullback-Leibler de y con respecto a x , la cual se define como:

D ( x   | |   y ) = i = 1 M p x i log p y i   log p x i
 (5)

Aquí, p x i   = x i / i = 1 M ρ x i corresponde a una versión normalizada del espectro x en la i-ésima banda espectral.

  • el híbrido SID-SAM entre los métodos SID y SAM, denominada SIDSAM, que se reporta como mejor discriminador que sus componentes por separado, obteniéndose mediante:

SIDSAM x ,   y    = SID x ,   y tan [ SAM x ,   y
 (6)
  • la distancia de Bhattacharyya (BhattD), teniendo en cuenta que sean p xi = ρ xi / i = 1 M ρ x i y p yi = ρ yi / i = 1 M ρ y i las versiones normalizadas de los espectros ρ x y ρ y en la i-ésima banda espectral, está dada por:

BhattD x ,   y    = ln i = 1 M p x i p y i   
 (7)
  • la distancia de Jeffries-Matusita (JMD), donde el criterio de separabilidad entre dos clases que son miembros de un conjunto de clases C(x, y = 1, 2,..., C, xy), basado en la JMD se ha definido como:

JMD x ,   y    =    2 1 e B h a t t D ρ x , ρ y
 (8)

siendo BhattD( x ,   y ) la distancia de Bhattacharyya entre las clases ρ x y ρ y , dada en (7) BhattD x ,   y    = ln i = 1 M p x i p y i    .

Además, se utilizaron también otras SMM, como el coeficiente Dice de similitud espectral (DSSC), el coeficiente de similitud espectral de Kumar-Johnson (KJSSC), y el DSSC-KJSSC híbrido (KJDSSC) (Kumar et al., 2021KUMAR, C.; CHATTERJEE, S.; OOMMEN, T.; GUHA, A.: “New effective spectral matching measures for hyperspectral data analysis”, International Journal of Remote Sensing, 42(11): 4126-4156, 2021, ISSN: 0143-1161.).

  • el coeficiente Dice de similitud espectral (DSSC), se define como:

DSSC x ,   y    =    2 i = 1 M ρ x i ρ y i i = 1 M ( ρ x i ) 2   +   i = 1 M ( ρ y i ) 2
 (9)
  • el coeficiente de similitud espectral de Kumar-Johnson (KJSSC), dado por:

KJSSC x ,   y    =    i = 1 M ρ x i 2 ρ y i 2 2 2 ρ x i ρ y i 3 / 2
 (10)
  • el híbrido KJDSSC que es la opción híbrida entre KJSSC y DSSC dada por:

KJDSSC x ,   y    = KJSSC x ,   y tan DSSC x ,   y  
 (11)

Finalmente se realizó un análisis de metamerismo a las SMM.

Resultados y Discusión

 

En las características de reflectancia espectral originales, fue común que todos los cultivares mostraran una banda ruidosa con fluctuaciones de mayor amplitud entre 932 y 985 nm, con amplitud semejante para todos los cultivares. Debido a que el ancho de banda de las bandas espectrales del espectrómetro utilizado es de 10 nm, mucho mayor al de otros espectrómetros comerciales, en los que es de solo 1 nm, la degradación de la relación señal-a-ruido fue baja.

El PCA se empleó para simplificar el manejo de los datos muestreados; esta transformación fue ortogonal, lo que significa que los componentes principales son independientes entre sí y se organizan de tal manera que el primero captura la mayor variabilidad presente en los datos, mientras que cada componente siguiente representa progresivamente menos varianza. Esto permite identificar las características más significativas al enfocarse en los valores propios más altos (Che’Ya et al., 2022CHE’YA, N.N.; MOHIDEM, N.A.; ROSLIN, N.A.; SABERIOON, M.; TARMIDI, M.Z.; ARIF SHAH, J.; FAZLIL ILAHI, W.F.; MAN, N.: “Mobile computing for pest and disease management using spectral signature analysis: A review”, Agronomy, 12(4): 967, 2022, ISSN: 2073-4395.). Luego de aplicar el PCA para cada uno de los cultivares, se pudo asumir la normalidad de los datos de cada una de las muestras de cada cultivar. Posteriormente, se obtuvieron los promedios de las lecturas de reflectancia suavizadas. Estos valores medios constituyen las firmas espectrales características de cada cultivar y se diferencian principalmente en la forma de la característica.

En la Figura 1 se observan las firmas espectrales promedio de cada cultivar superpuestas en una sola imagen, lo que permite apreciar mejor las diferencias entre ellas. Para un mismo cultivar el conjunto de características varia de una lectura a otra principalmente en amplitud; mientras que de un cultivar a otro las diferencias se deben a la forma de la característica. Esto involucra la presencia de diferentes gradientes entre algunas bandas espectrales. El gradiente (Primera Derivada), no depende de la amplitud de las características de reflectancia, sino de los cambios abruptos de amplitud entre longitudes de onda adyacentes en estas características. Estos cambios de alto gradiente son los que generalmente están asociados a picos de reflectancia característicos de los elementos constituyentes del cultivar analizado (Che’Ya et al., 2022CHE’YA, N.N.; MOHIDEM, N.A.; ROSLIN, N.A.; SABERIOON, M.; TARMIDI, M.Z.; ARIF SHAH, J.; FAZLIL ILAHI, W.F.; MAN, N.: “Mobile computing for pest and disease management using spectral signature analysis: A review”, Agronomy, 12(4): 967, 2022, ISSN: 2073-4395.). En la Figura 2A se muestra el resultado de calcular los gradientes de las características de las muestras de cada cultivar, elevarlos al cuadrado, promediados y suavizados con un filtro de promedio móvil con ventana de cinco muestras y respuesta finita al impulso (FIR) de fase cero.

Figura 1.  Características de reflectancia medias de los cultivares ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, ‘C1051-73’, ‘C86-12’, siendo ρ las reflectancia de los espectros.
Figura 2.  A Gradiente medio de reflectacia de las hojas de los cultivares en estudio elevado al cuadrado y suavizado. B Picos de gradiente medio de reflectacia de las hojas de los cultivares en estudio a 526,2 nm. C Picos de gradiente medio de reflectacia de las hojas de los cultivares en estudio en el borde rojo. D Picos de gradiente medio de reflectacia de las hojas de los cultivares en estudio entorno a los 1 400 nm.

Las características mostradas en la Figura 2 tienen semejante tendencia en cuanto a los picos de gradiente medio elevado al cuadrado asociados a los puntos de inflexión de las características de reflectancia de cada cultivar. Sin embargo, dichos picos constituyen los puntos claves que denotan diferencias entre los cultivares estudiados. Es importante destacar que estas diferencias no están influenciadas por factores externos; ya que todas las plantas de los distintos cultivares tenían seis meses de edad (lo cual corresponde con la etapa fenológica de ápido crecimiento del cultivo), fueron plantadas en zonas contiguas con iguales condiciones edafoclimáticas y las muestras fueron colectadas el mismo día. Por lo que estos picos de gradiente medio elevado al cuadrado deben estar asociados a las diferencias morfológicas y fisiológicas de los cultivares en estudio. Las características de reflectancia en las plantas se deben a las propiedades de la superficie y la estructura interna de la hoja, así como a la distribución y concentración de los componentes bioquímicos de la misma (Peñuelas y Filella, 1998PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.).

Como se observa en la Figura 2B, a los 526,2 nm todas las características de reflectancia tienen un pico de gradiente, de ellas, el mayor gradiente lo produce el cultivar ‘Ja60-5’, mientras que el cultivar ‘C90-176’ produce la transición de menor gradiente. Estos picos de gradiente ocurren en la región VIS del espectro electromagnético, la cual está comprendida en el rango de 400-700 nm. Los picos en esta región se relacionan con el efecto de las clorofilas y carotenoides (Peñuelas y Filella, 1998PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.). Cuando la luz solar incide sobre las hojas, parte de esta se absorbe con el objetivo de captar energía para la fotosíntesis. La energía que no se absorbe, es reflejada (Segarra et al., 2020SEGARRA, J.; BUCHAILLOT, M.L.; ARAUS, J.L.; KEFAUVER, S.C.: “Remote sensing for precision agriculture: Sentinel-2 improved features and applications”, Agronomy, 10(5): 641, 2020, ISSN: 2073-4395.; Singh et al., 2020SINGH, V.; SHARMA, N.; SINGH, S.: “A review of imaging techniques for plant disease detection”, Artificial Intelligence in Agriculture, 4: 229-242, 2020, ISSN: 2589-7217.; Sarić et al., 2022SARIĆ, R.; NGUYEN, V.D.; BURGE, T.; BERKOWITZ, O.; TRTÍLEK, M.; WHELAN, J.; LEWSEY, M.G.; ČUSTOVIĆ, E.: “Applications of hyperspectral imaging in plant phenotyping”, Trends in plant science, 27(3): 301-315, 2022, ISSN: 1360-1385.). Esto se define como reflexión espectral en la planta y se puede describir como el proceso donde las hojas absorben luz en la zona azul y roja visible debido a la presencia de la clorofila, dejando el reflejo dominante en la zona verde del espectro electromagnético (comprendida entre los 494-577 nm) (Aboelghar y Khdery, 2017ABOELGHAR, M.A.; KHDERY, G.A.: “Spectroscopic and morphological characteristics of genus Jatropha (Euphorbiaceae) and genus Jojoba (Simmondsiaceae)”, Asian Journal of Agriculture and Biology, 5(04), 2017, ISSN: 2307-8553.).

Los picos de gradiente medio a 526,2 nm (zona verde) son distintos entre los cultivares, lo que puede deberse a diferencias en la reflectancia de los pigmentos fotosintéticos de cada cultivar. Los mínimos de reflectancia corresponden con los máximos de absorción (Peña et al., 2019PEÑA, L.; RENTERÍA, V.; VELÁSQUEZ, C.; OJEDA, M.L.; BARRERA, E.: “Absorbancia y reflectancia de hojas de Ficus contaminadas con nanopartículas de plata”, Revista mexicana de física, 65(1): 95-105, 2019, ISSN: 0035-001X.). Por tanto, se puede deducir que mientras menor sea el valor de reflectancia, mayor será el valor de absorbancia; lo cual es directamente proporcional a la energía lumínica aprovechada por la planta.

En ciertos estudios se han definido longitudes de onda que se utilizan para calcular índices de reflectancia, los cuales son usados para determinar la eficiencia del proceso fotosintético (Peña et al., 2019PEÑA, L.; RENTERÍA, V.; VELÁSQUEZ, C.; OJEDA, M.L.; BARRERA, E.: “Absorbancia y reflectancia de hojas de Ficus contaminadas con nanopartículas de plata”, Revista mexicana de física, 65(1): 95-105, 2019, ISSN: 0035-001X.). Se observa que los menores valores de reflectancia en la zona verde de la región VIS se corresponden con una mejor eficiencia fotosintética, por lo que existe correlación negativa entre ellos. Lo anterior expuesto permite inferir que el cultivar `C90-176´, al tener el menor pico a los 526,2 nm, es el cultivar con mejor eficiencia fotosintética. Esto se corresponde con las características de este, que al ser un cultivar de caña energética, requiere de más energía para la producción de biomasa (Abril-González et al., 2019ABRIL-GONZÁLEZ, A.; RAMIL-MESA, M.; MILÁN, D.A.; CAMPO-ZABALA, R.: “Caña energética como combustible de calderas de biomasa. Propuesta de precio como alternativa al petróleo y al carbón”, Icidca, 53: 9, 2019.).

De las tres zonas de picos de gradiente medio elevado al cuadrado (526,2 nm, 723,8 nm y a 1 399 nm), la menos representativa en función de la diferenciación de los cultivares en estudio es la que ocurre a los 526,2 nm. Esto puede deberse a que la variabilidad de la reflectancia entre los cultivares en la zona verde del espectro es limitada porque las propiedades ópticas de la clorofila dominan la respuesta espectral. Esto hace que los picos en esta región no proporcionen información relevante en la discriminación entre cultivares al ser menos sensibles que las otras dos zonas en la región del infrarrojo cercano.

La Figura 2C representa los picos de gradiente medio de los cultivares en estudio en el borde rojo (700 - 745 nm). La razón de cambio en esta zona es mayor para el cultivar ‘C86-12’, mientras que el cultivar ‘C90-176’ transita con el menor gradiente en esta banda. Los altos valores de reflectancia en el borde rojo están asociados al contenido de clorofila en la hoja (Peñuelas y Filella, 1998PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.). Se ha destacado la utilidad que tiene el análisis derivativo de los datos de reflectancia en esta región para la identificación de la vegetación (Thorp y Tian, 2004THORP, K.; TIAN, L.: “A review on remote sensing of weeds in agriculture”, Precision Agriculture, 5(5): 477-508, 2004, ISSN: 1385-2256.).

De las tres zonas de picos de gradiente medio elevado al cuadrado (526,2 nm, 723,8 nm y a 1 399 nm), la más importante en función de la diferenciación de los cultivares en estudio es la que ocurre a los 723,8 nm. A pesar de que la clorofila sigue influyendo en esta región (al igual que ocurre en la zona de 526,2 nm); la reflectancia que ocurre en torno a los 700 - 745 nm es más sensible a las diferencias morfológicas y fisiológicas entre los cultivares (Feng, et al., 2013FENG, M.C.; WANG, J.J.; WANG, C.; YANG, W.D.; WANG, H.Q.; XIAO, L.J.; SONG, Y.H.; GAO, L.M.; ZHANG, M.J.; DING, G.W.: “Response of winter wheat (Triticum aestivum L.) spectral reflectance characteristics to chlorophyll content in planting densities application rate”, Bulgarian Journal of Agricultural Science, 19: 1190-1197, 2013.). Esto se debe a que a medida que las longitudes de onda se acercan a los 700 nm, la absorción de la clorofila disminuye drásticamente. Después de este punto las hojas comienzan a aumentar la reflectancia, lo que marca el inicio del borde rojo, una característica clave en la espectroscopía de las plantas (Gausman, 1974GAUSMAN, H.W.: “Leaf reflectance of near-infrared”, Photogrammetric Engineering, 40(2): 183-191, 1974.). Este cambio brusco es sensible a las condiciones de la hoja, como el contenido de clorofila o la estructura celular (Peñuelas y Filella, 1998PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.); lo que lo hace muy útil para distinguir entre cultivares.

Por esta razón, aunque la clorofila sigue siendo determinante en esta región, las diferencias en el contenido de clorofila entre los cultivares de caña de azúcar pueden generar un contraste más pronunciado en torno a los 723 nm. Esto permite que los espectros varíen de forma más notable entre cultivares, algo que no ocurre tanto en el rango de los 526,2 nm donde la reflectancia está más estabilizada por la fuerte absorción de la clorofila.

Finalmente, alrededor de 1 400 nm (NIR) todas las características producen otra zona con picos de gradiente, presentando el mayor gradiente el cultivar ‘Ja60-5’, mientras que el menor gradiente lo produce el cultivar ‘C90-176’ (Figura 2D). Estos picos de gradiente medio a 1 400 nm se deben a las discontinuidades entre las paredes celulares y los espacios con aire intercelulares en la estructura interna de la hoja (Yuan et al., 2014YUAN, L.; HUANG, Y.; LORAAMM, R.W.; NIE, C.; WANG, J.; ZHANG, J.: “Spectral analysis of winter wheat leaves for detection and differentiation of diseases and insects”, Field Crops Research, 156: 199-207, 2014, ISSN: 0378-4290.; Katsoulas et al., 2016KATSOULAS, N.; ELVANIDI, A.; FERENTINOS, K.P.; KACIRA, M.; BARTZANAS, T.; KITTAS, C.: “Crop reflectance monitoring as a tool for water stress detection in greenhouses: A review”, Biosystems Engineering, 151: 374-398, 2016, ISSN: 1537-5110.). Aunque esta longitud de onda no está directamente vinculada a los procesos bioquímicos de la fotosíntesis, tiene una relación indirecta con estos, especialmente en plantas C4 como la caña de azúcar. Estas plantas han desarrollado un mecanismo especializado para realizar la fotosíntesis de manera más eficiente en condiciones de luz y temperatura elevadas. Parte de esta eficiencia proviene de su estructura foliar, que optimiza la captura de CO2 y la reducción de la fotorrespiración (Moore y Botha, 2014MOORE, P.H.; BOTHA, F.C.: Sugarcane: Physiology, Biochemistry, and Functional Biology, Inst. Wiley Blackwell Online Library, Nueva Delhi, India, publisher: Wiley Online Library, 2014.). La estructura celular, incluidas las paredes celulares y los espacios intercelulares, tienen un papel crucial en facilitar el transporte de gases, lo que es vital para el funcionamiento del ciclo C4. La reflectancia en el NIR, puede capturar variaciones en estas propiedades estructurales Katsoulas et al. (2016)KATSOULAS, N.; ELVANIDI, A.; FERENTINOS, K.P.; KACIRA, M.; BARTZANAS, T.; KITTAS, C.: “Crop reflectance monitoring as a tool for water stress detection in greenhouses: A review”, Biosystems Engineering, 151: 374-398, 2016, ISSN: 1537-5110., reflejando diferencias en la organización celular que podrían influir en la eficiencia fotosintética.

Los picos en 1 400 nm también están altamente influenciados por el contenido de agua de las hojas, ya que esta longitud de onda es sensible a la reflectancia del agua en las estructuras celulares (Peñuelas y Filella, 1998PEÑUELAS, J.; FILELLA, I.: “Visible and near-infrared reflectance techniques for diagnosing plant physiological status”, Trends in plant science, 3(4): 151-156, 1998, ISSN: 1360-1385.). El contenido de agua es crucial para el mantenimiento de la turgencia celular, lo que impacta en la apertura de las estomas y, por tanto, en el intercambio de gases (CO2 y O2), un proceso fundamental en la fotosíntesis C4. Una planta C4 como la caña de azúcar, tiene una estructura celular optimizada para retener agua, reducir la transpiración y mantener un intercambio de gases eficiente Moore y Botha (2014)MOORE, P.H.; BOTHA, F.C.: Sugarcane: Physiology, Biochemistry, and Functional Biology, Inst. Wiley Blackwell Online Library, Nueva Delhi, India, publisher: Wiley Online Library, 2014., lo que podría reflejarse en la absorción o reflectancia en esta región del espectro.

Los espacios con aire entre las células permiten un transporte más eficiente de CO2 hacia las células especializadas en la fotosíntesis de las plantas C4. Esta característica es una ventaja que se aprovecha en el proceso fotosintético, pues es crucial en la fase de síntesis de carbohidratos. Si la reflectancia en 1 400 nm está asociada con la proporción de estos espacios intercelulares, podría estar reflejando características estructurales que favorecen la fotosíntesis eficiente en plantas C4. Aunque la absorción de los fotones que permiten la síntesis química en la fotosíntesis en sí ocurre en las longitudes de onda visibles, la arquitectura celular que facilita ese proceso se manifiesta en las longitudes de onda del NIR.

Otros autores han descrito que la región NIR que comprende las longitudes de onda de 1 300-1 400 nm está relacionada con la interacción de la energía incidente con la estructura mesófila de la hoja (de Souza et al., 2020DE SOUZA, M.F.; DO AMARAL, L.R.; DE MEDEIROS OLIVEIRA, S.R.; COUTINHO, M.A.N.; NETTO, C.F.: “Spectral differentiation of sugarcane from weeds”, Biosystems Engineering, 190: 41-46, 2020, ISSN: 1537-5110.). La caña de azúcar es una planta monocotiledónea; y las hojas de este tipo de plantas tienen más espacios aéreos dentro del mesófilo que las especies dicotiledóneas. De esta manera, este efecto tiene una influencia directa sobre la dispersión de la radiación de los cultivares de Saccharum spp. Además, se han descrito otros picos de gradiente medio útiles para la discriminación de cultivares y especies. Por ejemplo, al realizar la diferenciación entre cuatro cultivares brasileños de caña de azúcar mediante espectroscopía VIS-NIR, se encontró que todas las longitudes de onda contribuyeron a discriminar los cultivares de caña de azúcar, pero el rango de 600-750 nm fue el más relevante (Neto et al., 2018NETO, A.S.; LOPES, D.; TOLEDO, J.; ZOLNIER, S.; SILVA, T. da: “Classification of sugarcane varieties using visible/near infrared spectral reflectance of stalks and multivariate methods”, The Journal of Agricultural Science, 156(4): 537-546, 2018, ISSN: 0021-8596.). También, al diferenciar las plantas de caña de azúcar de las malezas por el comportamiento espectral de las hojas, se logró simplificar el espectro en sólo cuatro bandas de interés (500-550 nm; 650-750 nm; 1 300-1 450 nm; y 1 800-1 900 nm) (de Souza et al., 2020DE SOUZA, M.F.; DO AMARAL, L.R.; DE MEDEIROS OLIVEIRA, S.R.; COUTINHO, M.A.N.; NETTO, C.F.: “Spectral differentiation of sugarcane from weeds”, Biosystems Engineering, 190: 41-46, 2020, ISSN: 1537-5110.). Esto indica que las bandas usadas en la diferenciación pueden variar; pues las propiedades espectrales de las plantas dependen de su estado fisiológico, como la concentración de clorofila y otros pigmentos fotosintéticos, el contenido y estructura interna de las hojas y la influencia del estrés biótico y abiótico.

Las tres bandas de elevado gradiente, se muestran claramente como picos con valores máximos que forman combinaciones diferentes para cada cultivar posibilitando crear un espacio de rasgos. Con ello se logra una caracterización de las variaciones espectrales, que permite identificar las longitudes de onda significativas a partir de las cuales pueden implementarse estrategias de discriminación y clasificación (Agarla et al., 2021AGARLA, M.; BIANCO, S.; CELONA, L.; SCHETTINI, R.; TCHOBANOU, M.: “An analysis of spectral similarity measures”, En: Color and Imaging Conference, Ed. Society for Imaging Science and Technology, vol. 29, pp. 300-305, 2021, ISBN: 2166-9635.).

Los resultados permiten afirmar, que a partir de los espectros VIS-NIR los cultivares muestran rasgos característicos que permiten diferenciarlos unos de otros. De esta manera, es posible diferenciar la presencia de los cinco cultivares en el área a partir de la estructura interna de la hoja, la variabilidad en los elementos constituyentes de cada tejido vegetal y sus concentraciones entre los cultivares analizados.

Comparación de cinco cultivares comerciales de Saccharum spp. mediante diez medidas de correspondencia espectral

 

En la Tabla 1 se muestran los resultados de las diez SMM analizadas, representando el valor medio y la desviación estándar entre todas las muestras de cada cultivar, utilizando características de reflectancia con amplitud entre 0 y 1. En las medidas que determinan correlación (DSSC, SCM), los valores máximos están representados en color verde, mientras que los valores mínimos en color rojo. En las medidas que determinan distancia (SED, BhattD, JMD), similitud (KJSSC, KJDSSC), medida (SAM) o divergencia (SID, SIDSAM), los valores mínimos están representados en color verde, mientras que los valores máximos en color rojo.

La SED, dada por (1) SED x ,   y = x   ρ y 2 = i = 1 M ρ x i   ρ y i 2 1 / 2 se escaló por 0,5 ya que depende de las amplitudes. Cuando esta aumenta indica mayor distancia Euclidiana entre los espectros, lo que ocurre entre el cultivar ‘Ja60-5’ y el resto de los cultivares; presentando el valor más alto cuando se compara con el cultivar ‘C90-176’. Los valores más bajos para la SED fueron dados al comparar los cultivares ‘C1051-73’ y ‘C10-171’. El SAM, dado en (2) SAM x ,   y = cos 1 ρ x · ρ y T ρ x 2 2 ρ y 2 2 y llevado a grados (°), cuando aumenta indica mayor separación angular entre las características espectrales, lo que se obtiene entre los cultivares ‘C86-12’ y ‘C1051-73’, o ‘C90-176’; en ese orden. No siendo así para el SAM entre los cultivares ‘C1051-73’ y ‘C10-171’ o ‘Ja60-5’; en ese orden. La SCM, dada en (3) SCM x ,   y = i = 1 M ρ x i ρ ¯ x ρ y i ρ ¯ y i = 1 M ( ρ x i ρ ¯ x ) 2   i = 1 M ( ρ y i ρ ¯ y ) 2 , cuando disminuye indica menor correlación espectral, lo que se obtiene entre los cultivares ‘C86-12’ y el resto de los cultivares; presentando el valor más bajo con el cultivar ‘C1051-73’; no siendo así entre los cultivares ‘C1051-73’ y ‘C10-171’, ‘C1051-73’ y ‘Ja60-5’, y ‘C10-171’ y ‘Ja60-5’, donde el primer caso posee la mayor correlación espectral. Tanto para la SED, el SAM y la SCM los valores de desviación estándar no superaron los valores de las medidas.

Por otra parte, la SID, dada por (4) SID x ,   y = D ( x   | |   y )   + D ( y   | |   x ) y (5) D ( x   | |   y ) = i = 1 M p x i log p y i   log p x i escalada por 10, cuando aumenta indica mayor divergencia de información entre los espectros de reflectancia, obteniéndose las máximas divergencias entre el cultivar ‘C86-12’ y el resto de los cultivares. No sucede lo mismo entre los cultivares ‘C10-171’ y ‘C1051-73’; ya que se obtiene la más baja divergencia entre ellas. El SIDSAM, dado por (6) SIDSAM x ,   y    = SID x ,   y tan [ SAM x ,   y , también indica mayor discrepancia espectral cuando aumenta su valor, lo cual se obtiene entre el cultivar ‘C86-12’ y el resto de los cultivares. Al igual que para el SID, la menor diferencia se obtiene entre los cultivares ‘C10-171’ y ‘C1051-73’; no obstante, la desviación estándar en este caso supera el valor medio de la medida para la mayoría de los valores. La BhattD, dada en (7) BhattD x ,   y    = ln i = 1 M p x i p y i    y escalada por 10, cuando aumenta su valor denota más distancia entre las características espectrales, obteniéndose la mayor distancia entre los cultivares ‘C86-12’ y ‘C1051-73’. El menor valor de distancia se presentó entre los cultivares ‘C1051-73’ y ‘C10-171’.

Tabla 1.  Resultados de las diez SMM analizadas, representando el valor medio y la desviación estándar entre todas las muestras de cada cultivar, utilizando características de reluctancia con amplitud entre 0 y 1.
‘Ja60-5’ ‘C10-171’ ‘C90-176’ ‘C1051-73’ ‘C86-12’
SED
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,8775±0,3750 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 1,1121±0,2320 0,5751±0,3462 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,8114±0,3700 0,4800±0,4132 0,6553±0,4357 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,9122±0,3076 0,6997±0,3372 0,6097±0,3444 0,5064±0,2046 0,0000±0,0000
SAM
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 3,7128±1,8715 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 5,1013±1,6607 4,8122±1,3868 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 3,4983±1,5855 3,3288±1,5049 5,1397±1,7213 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 5,5087±2,5736 4,7847±2,9583 6,0161±2,5451 6,0556±3,4557 0,0000±0,0000
SCM
‘Ja60-5’ 1,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,9909±0,0087 1,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,9873±0,0088 0,9876±0,0108 1,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,9909±0,0079 0,9911±0,0082 0,9844±0,0148 1,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,9781±0,0336 0,9801±0,0399 0,9769±0,0317 0,9691±0,0463 1,0000±0,0000
SID
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,1310±0,1169 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,2177±0,1730 0,1738±0,0881 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,1444±0,1184 0,1254±0,1082 0,2569±0,1395 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,3295±0,3064 0,2760±0,4364 0,3560±0,2952 0,4884±0,4919 0,0000±0,0000
SIDSAM
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,0119±0,0175 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,0240±0,0278 0,0160±0,0123 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,0115±0,0139 0,0099±0,0121 0,0265±0,0214 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,0451±0,0762 0,0454±0,1175 0,0499±0,0613 0,0810±0,1347 0,0000±0,0000
DSSC
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,7316±0,0133 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,7240±0,0107 0,7402±0,0103 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,7338±0,0116 0,7417±0,0114 0,7367±0,0139 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,7318±0,0121 0,7367±0,0104 0,7388±0,0109 0,7426±0,0064 0,0000±0,0000
KJSSC
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 3,6963±2,2523 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 5,4460±3,8620 2,0686±1,5693 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 3,1767±1,9155 1,7244±1,9981 2,8639±2,3213 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 4,8575±3,0803 3,0374±3,0098 2,7792±2,3586 3,2666±3,2931 0,0000±0,0000
KJDSSC
‘Ja60-5’ 1,0000±0,0000
‘C10-171’ 3,2709±1,9369 1,0000±0,0000
‘C90-176’ 4,7620±3,2647 1,8627±1,3667 1,0000±0,0000
‘C1051-73’ 2,8283±1,6631 1,5407±1,7439 2,5450±1,9921 1,0000±0,0000
‘C86-12’ 4,3072±2,5909 2,7148±2,6437 2,4937±2,0725 2,9617±2,9057 1,0000±0,0000
BhattD
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,0158±0,0143 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,0266±0,0209 0,0211±0,0106 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,0174±0,0142 0,0152±0,0131 0,0313±0,0168 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,0401±0,0374 0,0334±0,0520 0,0433±0,0358 0,0589±0,0591 0,0000±0,0000
JMD
‘Ja60-5’ 0,0000±0,0000
‘C10-171’ 0,0313±0,0279 0,0000±0,0000
‘C90-176’ 0,0520±0,0401 0,0417±0,0207 0,0000±0,0000
‘C1051-73’ 0,0343±0,0277 0,0301±0,0257 0,0614±0,0324 0,0000±0,0000
‘C86-12’ 0,0774±0,0690 0,0632±0,0933 0,0836±0,0673 0,1113±0,1061 0,0000±0,0000

Nota: En las medidas que determinan correlación (DSSC, SCM), los valores máximos están representados en color verde, mientras que los valores mínimos en color rojo. En las medidas que determinan distancia (SED, BhattD, JMD), similitud (KJSSC, KJDSSC), medida (SAM) o divergencia (SID, SIDSAM), los valores mínimos están representados en color verde, mientras que los valores máximos en color rojo.

La JMD, dada por (8) JMD x ,   y    =    2 1 e B h a t t D ρ x , ρ y , al igual que la BhattD cuando aumenta su valor denota espectros más distantes y guarda una relación no lineal con la BhattD, mostrando que los mayores valores de distancia se producen entre el cultivar ‘C86-12’ y el resto de los cultivares, siendo con ‘C1051-73’ el mayor de todos. El menor valor de distancia se produce entre los cultivares ‘C10-171’ y ‘C1051-73’.

El DSSC, dado por (9) DSSC x ,   y    =    2 i = 1 M ρ x i ρ y i i = 1 M ( ρ x i ) 2   +   i = 1 M ( ρ y i ) 2 y escalado por 0,75, disminuye cuando las características de reflectancia son menos similares, lo que ocurre entre el cultivar ‘Ja60-5’ y el resto de los cultivares, siendo el valor más bajo cuando se compara con el cultivar ‘C90-176’. El valor de DSSC más alto se obtiene entre los cultivares ‘C86-12’ y ‘C1051-73’. El KJSSC, dado por (10) KJSSC x ,   y    =    i = 1 M ρ x i 2 ρ y i 2 2 2 ρ x i ρ y i 3 / 2 y escalado por 0,1, aumenta su valor cuando las características espectrales son menos similares, siendo los coeficientes entre el cultivar ‘Ja60-5’ y el resto de los cultivares los de mayor valor. Por el contrario, el cultivar ‘C10-171’ comparado con ‘C1051-73’ obtiene el valor más bajo de KJSSC. Finalmente, el KJDSSC, dado por (11) KJDSSC x ,   y    = KJSSC x ,   y tan DSSC x ,   y   , también aumenta su valor cuando las características espectrales son menos similares, coincidiendo sus resultados con las del KJSSC.

Los resultados de las diez SMM muestran como patrón general que los cultivares ‘Ja60-5’ y ‘C86-12’ son los cultivares más diferentes del resto. En este sentido, el cultivar ‘C86-12’ alcanzó los valores más significativos cuando se comparó con ‘C1051-73’; y el cultivar ‘Ja60-5’ obtuvo sus valores más representativos al compararse con ‘C90-176’. Por otra parte, los cultivares ‘C10-171’ y ‘C1051-73’ son los más similares entre sí.

Solo cuando se compara un cultivar consigo mismo los valores de distancia, similitud, medida o divergencia toman valor cero, o las correlaciones toman valor uno, de no ser así ocurriría metamerismo. El metamerismo es el efecto que se produce cuando dos espectros diferentes producen igual percepción de las fuentes que reflejan tales espectros (Agarla et al., 2021AGARLA, M.; BIANCO, S.; CELONA, L.; SCHETTINI, R.; TCHOBANOU, M.: “An analysis of spectral similarity measures”, En: Color and Imaging Conference, Ed. Society for Imaging Science and Technology, vol. 29, pp. 300-305, 2021, ISBN: 2166-9635.). En este caso ocurrirá metamerismo entre dos lecturas de reflectancia espectral de cultivares diferentes si las SMM que determinan distancia (SED, BhattD, JMD), similitud (KJSSC, KJDSSC), medida (SAM) o divergencia (SID, SIDSAM) entre ellas dan como resultado valor cero, así como cuando las SMM que determinan correlación (DSSC, SCM) dan como resultado valor uno.

En el análisis de las SMM ninguno de los valores mínimos se hace cero, siendo el SIDSAM el que produce los valores más cercanos a cero, principalmente comparando el cultivar ‘C1051-73’ con ‘C10-171’ (0,0099); no obstante, también los valores de SIDSAM para estos pareos de cultivares son bajos. Por otro lado, las medidas de correlación (SCM y DSSC), que toman valor uno cuando ocurre metamerismo, o cuando se compara una especie consigo misma, obtienen su valor más alto para la SCM cuando se compara el cultivar ‘C1051-73’ con ‘C10-171’ (0,9911).

Finalmente, se puede referir que a partir de los resultados mostrados y después de probar la normalidad de los valores de reflectancia para las diversas lecturas de una misma muestra, se determinaron las características medias y de desviación estándar de cada una. El bundle de estas características medias de los cultivares estudiados representó la variabilidad de los mismos. Se identificó que, a 526,2 nm, 723,8 nm y a 1 399 nm existen diferencias en los gradientes de las características espectrales de los cinco cultivares estudiados. Diversas SMM corroboraron que existe posibilidad de discriminar ente los cultivares sin que ocurra metamerismo. De ellas, la SED, el SAM y la SCM son las que brindan los mejores resultados. Además, fueron las tres medidas de correspondencia espectral en las que ninguno de los valores de desviación estándar superó los valores medios.

Los métodos computacionales de análisis espectral se han utilizado para distinguir especies y cultivares basándose en el supuesto de que cada uno tiene ciertas características que pueden usarse para diferenciarlos de otros, que generalmente son la forma, el tamaño y la reflectancia de las hojas (Cisternas et al., 2020CISTERNAS, I.; VELÁSQUEZ, I.; CARO, A.; RODRÍGUEZ, A.: “Systematic literature review of implementations of precision agriculture”, Computers and Electronics in Agriculture, 176: 105626, 2020, ISSN: 0168-1699.). En un estudio similar, se identificaron otras longitudes de onda para discriminación de cultivares comerciales de Saccharum spp. que oscilaban entre 560 y 720 nm (Johnson et al., 2008JOHNSON, R.M.; VIATOR, R.P.; VEREMIS, J.C.; RICHARD, E.P.; ZIMBA, P.V.: “Discriminación de variedades de caña de azúcar con perfiles de pigmentos y datos de reflectancia foliar hiperespectral de alta resolución”, Journal Association Sugar Cane Technologists, 28: 63-75, 2008.). Los resultados indican que las bandas para discriminar cultivares pueden variar y deben ser investigados más de cerca para permitir un mapeo adecuado de cultivares de caña de azúcar, atendiendo al área y las características de los cultivares en estudio.

La firma espectral de cada cultivar tiene una curva gráfica diferente según sus características específicas. Por tanto, se puede utilizar una biblioteca espectral para comparar la reflectancia de cultivares de caña de azúcar en un campo y estimar la frecuencia de los mismos; además esta biblioteca se puede utilizar para discriminar e identificar la ubicación de la planta (Kai et al., 2020KAI, P.M.; DA COSTA, R.M.; DE OLIVEIRA, B.M.; FERNANDES, D.S.; FELIX, J.; SOARES, F.: “Discrimination of sugarcane varieties by remote sensing: A review of literature”, En: 2020 IEEE 44th Annual Computers, Software, and Applications Conference (COMPSAC), Ed. IEEE, pp. 1212-1217, 2020, ISBN: 1-7281-7303-5.).

Conclusiones

 
  • Es posible determinar las firmas espectrales de los cultivares comerciales de Saccharum spp., ‘Ja60-5’, ‘C10-171’, ‘C90-176’, ‘C1051-73’, ‘C86-12’, a 526,2 nm, 723,8 nm y a 1 399 nm donde a una longitud de onda de reflactacnia de 526,2 nm, 723,8 nm y a 1 399 nm, existen diferencias en los gradientes de las características espectrales de estos.

  • Las diez medidas de correspondencia espectral permiten diferenciar los cultivares comerciales de Saccharum spp., sin ocurrencia de metamerismo.

Agradecimientos

 

Este artículo ha sido posible gracias al proyecto de investigación “Soluciones para la agricultura y el medio ambiente basados en vehículos no tripulados, articulados a una infraestructura de datos espaciales”, del Programa Nacional “Automática, Robótica e Inteligencia Artificial”. ARIA, PN223LH004